小小角苔會“借”基因——首個高質量角苔參考基因組發布
中國科學院植物研究所研究員陳之端團隊通過一系列精細設計的去污染流程，得到了119 Mb的芽胞角苔基因組組裝結果，獲得了第一個高質量的角苔參考基因組，填補了苔蘚類植物相關研究的空白。相關成果2月10日作為封面文章在線發表于國際學術期刊《自然—植物》（Nature Plants）上。圖片來源于網絡 陳之端研究組于2008年啟動了角苔基因組測序計劃，經過多年攻關，終于在角苔基因組的解析上獲得了突破。該研究通過系統發育基因組學分析進一步確定了苔蘚類植物的單系性，并支持角苔類位于苔蘚類分支的最基部。 研究人員發現，在植物登陸過程中，角苔可謂“輕裝上陣”，具有一套與其簡單的形態結構相匹配的低冗余度的小基因組；同時其基因組又不失功能的完備性，包含了與植物發育相關的基本轉錄調控工具包。與之相對，在角苔基因組當中與RNA編輯、UV耐受以及抗脫水等環境適應相關的基因家族卻通過串聯重復獲得了擴張，同時角苔還受益于從土壤細菌和真菌轉移而來的基因......閱讀全文
小小角苔－會“借”基因——首個高質量角苔參考基因組發布
中國科學院植物研究所研究員陳之端團隊通過一系列精細設計的去污染流程，得到了119 Mb的芽胞角苔基因組組裝結果，獲得了第一個高質量的角苔參考基因組，填補了苔蘚類植物相關研究的空白。相關成果2月10日作為封面文章在線發表于國際學術期刊《自然—植物》（Nature Plants）上。圖片來源于網絡
我國學者攻破高質量角苔參考基因組
苔蘚類包括苔、蘚和角苔三大分支，是現存最早的陸生植物，代表了植物演化過程中從水生到陸生的過渡類群。長久以來關于早期陸地植物的起源與植物登陸一直存在諸多爭論和未解之謎。近年來，人們利用組學數據將早期陸地植物的系統位置爭論聚焦到了角苔類上。角苔類以其難解的系統位置、衍生與原始兼具的形態特征、與細菌和
蕓苔的概述
蕓薹（拉丁學名：Brassica campestrisL.），十字花科蕓苔屬植物。它為二年生草本，高30~90厘米，葉柄寬，長2~6厘米，基部抱莖。其總狀花序在花期成傘房狀，以后伸長；花鮮黃色，直徑7~10毫米；萼片長圓形，長3~5毫米，直立開展，頂端圓形，邊緣透明，稍有毛。它產于陜西、江蘇、安
蕓苔的簡介
蕓薹（拉丁學名：Brassica campestrisL.），十字花科蕓苔屬植物。它為二年生草本，高30~90厘米，葉柄寬，長2~6厘米，基部抱莖。其總狀花序在花期成傘房狀，以后伸長；花鮮黃色，直徑7~10毫米；萼片長圓形，長3~5毫米，直立開展，頂端圓形，邊緣透明，稍有毛。它產于陜西、江蘇、安
基因編輯技術讓奶牛不長角
在美國，每年近80%的奶牛的角要被移除，以保護操作工人和其他奶牛。不過，這一做法既痛苦又昂貴，因此受到動物權益保護者越來越多的關注。 如今，科學或許能施以援手：一群研究人員日前宣稱，他們成功編輯了奶牛基因組，能使奶牛不長角。科學家利用轉錄激活子樣效應因子核酸酶DNA編輯技術，將一種同不長角存在
科學家發表苔蘚多樣性、系統發育和適應性綜述
近日，中國科學院植物研究所科研人員與合作者在《實驗植物學雜志》上發表了基于基因組和轉錄組數據針對苔蘚植物的多樣性、系統發育和適應性研究的綜述，該綜述對目前已經發布的14個苔蘚植物的基因組和151個苔蘚植物的轉錄組進行了總結和梳理。 苔蘚植物包括苔、蘚和角苔三大分支，是現存最早的陸生植物，為
瀕危植物報春苣苔交配系統轉變基因組效應獲揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488438.shtm 近日，中國科學院華南植物園植物科學研究中心研究員康明團隊以苦苣苔科報春苣苔（Primulina tabacum）為對象，研究揭示了瀕危植物報春苣苔交配系統由異交向自交轉變的基因
蕓苔素內酯的作用特性
蕓苔素內酯是甾體化合物中生物活性較高的一種，他們廣泛存在于植物體內。在植物生長發育各階段中，既可促進營養生長，又能利于受精作用。人工合成的蕓苔素內酯活性較高，可經由植物的葉、莖、根吸收，然后傳導到起作用的部位，有的認為可增加RNA聚合酶的活性，增加RNA、DNA含量，有的認為可增加細胞膜的電勢差
首個葡萄完整參考基因組發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503617.shtm近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所作物組學大數據與應用創新團隊聯合國外科研團隊，繪制了首個葡萄完整參考基因組圖譜。研究成果以封面文章發表在《園藝研究》（Horticulture
首個葡萄完整參考基因組發布
記者從中國農科院獲悉， 該院的深圳農業基因組研究所作物組學大數據與應用創新團隊聯合國外科研團隊，于近日繪制了首個葡萄完整參考基因組圖譜。 該研究成果作為封面文章發表在《園藝研究（Horticulture Research）》上，以致敬沃森和克里克提出DNA雙螺旋結構模型七十周年。 據介紹，該
華南植物園在報春苣苔屬葉綠體基因組裝研究取得進展
報春苣苔屬是典型的喀斯特巖溶洞穴植物，具有非常豐富的物種多樣性和特有性，是研究喀斯特植物適應性進化和物種形成的理想模式。圖1. 報春苣苔屬葉綠體基因組一致性圈圖 中科院華南植物園植物科學研究中心馮超博士等人在康明研究員的指導下，以報春苣苔屬植物為材料，率先搭建了該屬三個完整的葉綠體基因組并進行
長瓣馬鈴苣苔的概述
長瓣馬鈴苣苔（拉丁學名：Oreocharis auricula），別名絹毛馬鈴苣苔、絨毛馬鈴苣苔。苦苣苔科馬鈴苣苔屬多年生無莖草本植物。 長瓣馬鈴苣苔葉全部基生，具柄；葉長圓狀橢圓形，上面被貼伏短柔毛，下面被淡褐色絹狀綿毛至近無毛，花序梗被褐色絹狀綿毛；聚傘花序2次分枝，苞片長圓狀披針形；花梗
什么是長瓣馬鈴苣苔
長瓣馬鈴苣苔（拉丁學名：Oreocharis auricula），別名絹毛馬鈴苣苔、絨毛馬鈴苣苔。苦苣苔科馬鈴苣苔屬多年生無莖草本植物。 長瓣馬鈴苣苔葉全部基生，具柄；葉長圓狀橢圓形，上面被貼伏短柔毛，下面被淡褐色絹狀綿毛至近無毛，花序梗被褐色絹狀綿毛；聚傘花序2次分枝，苞片長圓狀披針形；花梗
蕓苔素內酯的實用功效
具有生根、促進生長、提苗、壯苗、保苗、黃葉病葉變綠、促進受精、保花保果、促進果實膨大早熟、減輕病害緩解藥害、協調營養平衡、抗旱抗寒、降低作物體內農藥殘留、增強作物抗逆性等多重功能。對因重茬、病害、藥害、凍害等原因造成的死苗、爛根、立枯、猝倒現象急救效果顯著，施用12—24小時即明顯見效，迅速恢復
長瓣馬鈴苣苔的簡介
長瓣馬鈴苣苔（拉丁學名：Oreocharis auricula），別名絹毛馬鈴苣苔、絨毛馬鈴苣苔。苦苣苔科馬鈴苣苔屬多年生無莖草本植物。 長瓣馬鈴苣苔葉全部基生，具柄；葉長圓狀橢圓形，上面被貼伏短柔毛，下面被淡褐色絹狀綿毛至近無毛，花序梗被褐色絹狀綿毛；聚傘花序2次分枝，苞片長圓狀披針形；花梗
－震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！
?震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！ 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低，全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源，但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用，使得基因組數據面臨很多問題。 近日，約翰霍
Nature：系統解析斑馬魚參考基因組
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
華大基因構建全球首個小鼠腸道微生物參考基因集
2015年9月28日，中國深圳—深圳華大基因研究院、哥本哈根大學等研究機構共同構建了全球首個小鼠腸道微生物參考基因集，為以小鼠為基礎的人類疾病模型研究提供有益參考。最新研究成果今日在線發表于《自然生物技術》。 人類的腸道中居住著種類繁多，數量驚人的微生物，而在這些微生物中，細菌的比例高達90%
基因組學研究重建苔類植物演化歷程獲突破
深圳市仙湖植物園研究團隊與合作者使用轉錄組數據，首次對苔類目級系統框架進行了重建，得到了高支持的系統發育樹。相關研究9月8日在線發表于Annals of Botany。該論文第一作者為深圳市仙湖植物園董珊珊副研究員，通訊作者為劉陽研究員。深圳市仙湖植物園張力研究員，深圳華大生命科學研究院聯合培養研究
長瓣馬鈴苣苔的分布范圍
產廣東、廣西西北部、江西、湖南、貴州（梵凈山）及四川（秀山）。 生于山谷、溝邊及林下潮濕巖石上，海拔400-1600米。 模式標本采自江西廬山。
長瓣馬鈴苣苔的形態特征
多年生草本。 葉全部基生，具柄；葉片長圓狀橢圓形，長2-8.5厘米，寬1-5厘米，頂端微尖或鈍，基部圓形或稍心形，或近楔形，邊緣具鈍齒至近全緣，上面被貼伏短柔毛，下面被淡褐色絹狀綿毛至近無毛，側脈每邊7-9條，在下面隆起，密被褐色絹狀綿毛；葉柄長2-4厘米，密被褐色絹狀綿毛。 聚傘花序2次分
長瓣馬鈴苣苔的理化鑒別
1、取該品粉末（40目）1g，加甲醇10ml置水浴上加熱浸漬10分鐘，過濾。取濾液1ml，加三氯化鐵試液1滴，溶液顯藍綠色至藍黑色。（鞣質） 2、薄層層析 樣品制備：取該品粉末（40目）1g，加乙醚10ml，回流10分鐘，過濾。取濾液5ml，揮去乙醚，加甲醇0.5ml溶解，點樣20μl。對照
長瓣馬鈴苣苔的性狀鑒別
根莖呈類圓柱形而稍扁，略彎曲，長10～30cm，直徑1～2cm。表面棕灰色至棕黑色，具密集而稍隆起的環節，節間長1～6～11mm，節上有的有棕黑色葉基殘存，并有皺縮條紋及凹點狀或突起的根痕。質堅實而脆，易折斷，折斷面類白色或粉紅色，粉性，近邊緣有類白色點狀維管束環列，一側點稍大，另一側點較小，有
染色體水平冬瓜參考基因組發布
近日，廣東省農業科學院蔬菜研究所發布了染色體水平冬瓜參考基因組。相關研究發表于Scientific Data，廣東省農業科學院蔬菜研究所副研究員羅文龍和副研究員閆晉強為該論文共同第一作者，廣東省農業科學院蔬菜研究所研究員江彪為通訊作者。廣東省農業科學院蔬菜研究所于2019年對黑皮大冬瓜B227進行基
我國科研團隊發布水稻完整參考基因組
水稻是重要的糧食作物，其基因組組裝對水稻育種意義重大。23日，記者從中國農業科學院深圳農業基因組研究所獲悉，該所聯合崖州灣實驗室、中國水稻研究所、中國農科院作物科學研究所和揚州大學等多個單位發布完整的水稻參考基因組，實現了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要
單分子測序輕松升級參考基因組
現代基因組學的最大需求之一，就是得到人類和模式生物的高質量完成基因組。目前，人們利用二代測序技術對越來越多的物種(從原核生物到真核生物)進行了基因組測序，取得了許多重要的研究成果。 不過大部分物種的基因組還中存在有大量的缺口gap，就目前的數據來說，各種已測序物種的基因組中缺口gap所占的
一種全新的人類參考基因組
人類基因組計劃是人類最偉大的勝利之一。這項計劃所產生的基因組圖譜也成為參考基因組，沿用至今。然而，據MIT Technology Review報道，一些研究人員認為這種方法已經過時了。 如今，科學家正在醞釀一種新的通用圖譜。他們表示，這將結合數百人甚至數千人的基因組來創造一個能反映全人類的真正
無缺口組裝！水稻完整參考基因組發布
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合海南崖州灣實驗室、中國水稻研究所、中國農科院作物科學研究所和揚州大學等多個單位發布完整的水稻參考基因組，實現了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要大數據基礎。相關研究成果發表在《分子植物》（Molecular
檢出角
理論上該角度越大越好。目前的角點檢測算法可歸納為3類：基于灰度圖像的角點檢測、基于二值圖像的角點檢測、基于輪廓曲線的角點檢測。角點是圖像很重要的特征，對圖像圖形的理解和分析有很重要的作用。對灰度圖像、二值圖像、邊緣輪廓曲線的角點檢測算法進行綜述，分析了相關的算法，并對各種檢測算法給出了評價。
固體角
也叫立體角，決定了信號量的大小，該角度越大越好。固體角常用字母Ω表示，是一個物體對特定點的三維空間的角度，是平面角在三維空間中的類比。它描述的是站在某一點的觀察者測量到的物體大小的尺度。例如，對于一個特定的觀察點，一個在該觀察點附近的小物體有可能和一個遠處的大物體有著相同的立體角。立體角： ?以觀測