RIP技術——研究腫瘤發生和轉移中microRNA失調的有力工具一
microRNAs（miRNA）是一種內源性非編碼小分子RNA，一般具有18到25個核苷酸，其序列在進化上高度保守，通過靶向特定mRNA來調節基因的表達。miRNA是越來越受關注的轉錄后調控網絡（post-transcriptional control）中重要的調控因子。首先，miRNA結合到核糖核蛋白（Ribonucleoprotein，RNP）復合物中，形成RNA誘導的沉默復合體（RNA-induced silencing complex, RISC），然后通過不完全的堿基互補靶向到目標mRNA的3’UTR區，再通過引導酶切影響了mRNA的穩定性，或直接阻礙翻譯過程，從而介導特異mRNA靶標的轉錄后基因沉默。miRNA參與轉錄后調控網絡。miRNA靶向到目標mRNA的3’UTR區，抑制靶mRNA的蛋白表達。（摘自Chatterjee & Pal, Biol Cell. 2009）miRNA對許多生理過......閱讀全文
RIP技術簡介
由于miRNA被發現在癌癥機理中起重要的作用，尤其是與腫瘤轉移相關聯，因此對于miRNA的研究來說，最讓人興奮的是有希望應有于癌癥治療中的RNA 抑制療法或模擬miRNA表達療法，尤其是對于出現腫瘤轉移的癌癥病人的治療。但是miRNA具有成百上千個靶標，所以要完全理解一個miRNA和靶標的特異性反應
RIP技術（RNA結合蛋白免疫沉淀）
RIP技術（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA結合蛋白免疫沉淀），是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具，能幫助我們發現miRNA的調節靶點。RIP這種新興的技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合
RIP－實驗基本原理
（1）用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白。（2）防止非特異性的RNA的結合。（3）免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來。（4）結合的RNA序列通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或高通量測序（RIP-Seq）方法來鑒定。
基于磁珠的RIP實驗流程
RIP 實驗基本原理：? 用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白。? 防止非特異性的RNA的結合。? 免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來。? 結合的RNA序列通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或 高通量測序（RIP-Seq）方法來
基于磁珠的RIP實驗流程
RIP 實驗基本原理：? 用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白。? 防止非特異性的RNA的結合。? 免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來。? 結合的RNA序列通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或 高通量測序（RIP-Seq）方法來
基于磁珠的RIP實驗流程
RIP 實驗基本原理：? 用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白。? 防止非特異性的RNA的結合。? 免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來。? 結合的RNA序列通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或 高通量測序（RIP-Seq）方法來
RIP－技術研究腫瘤發生和轉移中microRNA失調的有力工具
microRNAs（miRNA）是一種內源性非編碼小分子RNA，一般具有18到25個核苷酸，其序列在進化上高度保守，通過靶向特定mRNA來調節基因的表達。 miRNA是越來越受關注的轉錄后調控網絡（post-transcriptional control）中重要的調控因子。首先，miRNA
RIP－技術研究腫瘤發生和轉移中microRNA失調的有力工具
microRNAs（miRNA）是一種內源性非編碼小分子RNA，一般具有18到25個核苷酸，其序列在進化上高度保守，通過靶向特定mRNA來調節基因的表達。 miRNA是越來越受關注的轉錄后調控網絡（post-transcriptional control）中重要的調控因子。首先，miRNA
RIP技術研究腫瘤發生和轉移中microRNA失調的有力工具
microRNAs（miRNA）是一種內源性非編碼小分子RNA，一般具有18到25個核苷酸，其序列在進化上高度保守，通過靶向特定mRNA來調節基因的表達。miRNA是越來越受關注的轉錄后調控網絡（post-transcriptional control）中重要的調控因子。首先，miRNA結合到核糖核
RIP－技術——研究腫瘤發生和轉移中microRNA失調的有力工具－二
但是miRNA具有成百上千個靶標，所以要完全理解一個miRNA和靶標的特異性反應與腫瘤發生之間的聯系，是一項非常具有挑戰性的工作，尤其是在癌癥研究中鑒別出miRNA的準確靶點仍然是一大難題。現已知道miRNA的調節功能是通過結合不同的蛋白質或RNA來實現的，因此研究miRNA與蛋白的結合情況對于揭示
RIP－技術——研究腫瘤發生和轉移中microRNA失調的有力工具－一
microRNAs（miRNA）是一種內源性非編碼小分子RNA，一般具有18到25個核苷酸，其序列在進化上高度保守，通過靶向特定mRNA來調節基因的表達。miRNA是越來越受關注的轉錄后調控網絡（post-transcriptional control）中重要的調控因子。首先，miRNA結合
研究揭示細胞生死的關鍵調控因子RIP1激酶活性作用機制
6月2日，國際學術期刊《細胞死亡與分化》（Cell death and Differentiation）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院（人口健康領域）章海兵研究組的最新研究成果RIP1 kinase activity-dependent roles in embryonic develo
RNA蛋白免疫沉淀技術簡介
RIP技術（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA結合蛋白免疫沉淀），是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具，能幫助我們發現miRNA的調節靶點。RIP這種新興的技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合
免疫沉淀法的主要類型
個別免疫沉淀法(IP)：用來分離某個細胞萃取物中的已知特定蛋白質免疫共沉淀法(Co-IP)：研究整個蛋白質復合體染色質免疫沉淀法(ChIP)：用來研究DNA上的特定蛋白質RNA免疫沉淀法(RIP)：和ChIP相近，但RNA免疫沉淀法是用來研究會與RNA結合的蛋白質RIP技術（RNA Binding
免疫沉淀法的類型
個別免疫沉淀法(IP)：用來分離某個細胞萃取物中的已知特定蛋白質免疫沉淀法免疫共沉淀法(Co-IP)：研究整個蛋白質復合體染色質免疫沉淀法(ChIP)：用來研究DNA上的特定蛋白質RNA免疫沉淀法(RIP)：和ChIP相近，但RNA免疫沉淀法是用來研究會與RNA結合的蛋白質RIP技術（RNA Bin
我國自主研發RiP實現熱液區倒置湖中超高溫氣態水觀測
水的相態受控于其所處的溫度、壓力條件，當溫度超出其所處壓力下氣液分離溫度時，液態水將轉變為氣態水。在一個大氣壓下，純水會在一百攝氏度氣化，即“白開水”的由來。但在深海海底高壓環境下，海水的氣化溫度可達幾百攝氏度，那么在深海是否存在大量超高溫的氣態水呢？ 中國科學院海洋研究所閻軍課題組在2018
營養與健康所等揭示T細胞免疫穩態與衰老的作用關系
11月16日，中國科學院上海營養與健康研究所章海兵課題組、上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院與上海市第六人民醫院，在EMBO Reports上，在線發表了題為Excessive apoptosis of Rip1-deficient T cells leads to premature aging的
m5C－RNA修飾靶基因驗證
技術簡介 RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡的有力工具。這種技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，然后經過分離純化就可以對結合在復合物上的RNA進行分析。RIP-Seq將RIP技
我國學者發現新的天然免疫信號通路
我國學者首次發現壞死小體蛋白復合物RIP1-RIP3及其下游信號通路在核糖核酸（RNA）病毒感染誘導的炎性小體形成中起關鍵作用，從而發現一條新的天然免疫抗病毒信號通路，為病毒感染相關炎癥性疾病的治療提供了潛在的治療靶點。該研究論文近日在線發表于國際權威免疫學雜志《自然·免疫》上。 該研究由中國
探索RNA與蛋白的相互作用，你需要這兩種檢測
從DNA到蛋白質，這是一個相當復雜的過程。轉錄DNA的代碼，這只是萬里長征的第一步。隨后，大量蛋白質編輯RNA，帶領它從細胞核到細胞質，控制其穩定性，并指導其翻譯。 據印第安納大學的副教授Sarath Chandra Janga介紹，數百個RNA結合蛋白（RBP）參與了這個過程。Janga正在
順鉑神經毒性機制解密——由RIP3介導的壞死性凋亡所致
癌癥在全球的發病率日益升高，化療在惡性腫瘤治療中不可或缺，順鉑又名順氯氨鉑，為目前常用的金屬鉑絡合物，抗癌譜廣，臨床主要用于治療頭頸部鱗狀細胞癌、卵巢癌、睪丸癌及膀胱、食管、肺等部位的上皮細胞癌，是當前相當有效的化療藥物之一，對腫瘤的放療亦有增敏作用。 然而，在使用順鉑治療的同時，也不可忽視順
RIP測序解析RNA結合蛋白SORBS2在卵巢癌細胞轉移中的作用...
RIP測序解析RNA結合蛋白SORBS2在卵巢癌細胞轉移中的作用機制作為環狀RNA和RNA甲基化領域的領跑者，云序生物最近一個月捷報頻傳。RNA甲基化領域，云序m6ARNA甲基化測序服務協助上海交大余健秀組發表18年國內首篇10分以上RNA甲基化文章（“Nucleic Acid Research”，
RIP測序解析RNA結合蛋白SORBS2在卵巢癌細胞轉移作用機制
作為環狀RNA和RNA甲基化領域的領跑者，云序生物最近一個月捷報頻傳。RNA甲基化領域，云序m6ARNA甲基化測序服務協助上海交大余健秀組發表18年國內首篇10分以上RNA甲基化文章（“Nucleic Acid Research”，IF:10.162)；環狀RNA領域，云序環狀RNA測序服務助力
RIP測序解析RNA結合蛋白SORBS2在卵巢癌細胞轉移中作用機制
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉
中科大，廈門大學Nature子刊取得免疫首發性成果
近日，中國科學技術大學生命科學學院、中科院天然免疫與慢性疾病重點實驗室周榮斌教授研究組、田志剛教授研究組與廈門大學韓家淮教授研究組合作，在機體抗病毒天然免疫領域取得重要突破，首次發現壞死小體蛋白復合物RIP1-RIP3及其下游信號通路在RNA病毒感染誘導的炎性小體活化及炎性反應發
分子細胞卓越中心發現功能性淀粉樣蛋白纖維解聚酶抑制程序性細胞壞死
8月14日，中國科學院分子細胞科學卓越創新中心孫麗明研究組在《細胞研究》（Cell Research）上，在線發表了題為HSPA8 acts as an amyloidase to suppress necroptosis by inhibiting and reversing functional
ANKRD13a通過獨立于NFκB與RIP1相互作用控制……
腫瘤壞死因子(TNF)是一種多效性細胞因子，可引起多種細胞反應，從炎癥、增殖到程序性細胞死亡(PCD)，以凋亡和壞死下垂的形式出現。這種多效性主要取決于兩個順序信號復合體的平衡：質膜結合的初級復合體和細胞質次級復合體，分別稱為復合體-I和復合體-II。 在腫瘤壞死因子信號轉導中，RIP1的泛素
從RIP1激酶抑制劑GSK2982772看創新藥物研發起點的重要性
受體相互作用蛋白1（RIP1）可以調節細胞壞死和發炎，在人體病理學上也扮演著重要的角色，如免疫調節和炎癥疾病。 Harris等人在早在2016年初即報道了在DNA編碼化合物庫中找到了一個優秀的抑制RIP1激酶的苯并惡嗪酮類先導化合物（GSK481）。時隔一年，他們再次撰文報道通過優化GSK48
PRMT1調節的壞死和結腸癌免疫的分子機制
壞死性細胞死亡的特征是細胞腫脹、質膜破裂和細胞器破裂，這與凋亡和其他類型的細胞死亡不同。壞死曾經被認為是一種由物理化學應激引起的不受調節的細胞死亡，直到程序性壞死（稱為壞死）被解開。壞死在壞死性癌癥細胞死亡和腫瘤免疫逃逸中起著雙刃劍的作用。癌癥是如何通過免疫逃逸和腫瘤進展導致細胞壞死的，目前尚不
吳浩教授Cell文章細胞死亡機制新發現
淀粉樣蛋白沉積物常被視為垃圾——阻塞細胞的有毒廢物。在最新一期(7月20日)《細胞》(Cell)雜志的一篇論文中，研究人員證實至少有一種類型的淀粉樣蛋白在生理信號中發揮了至關重要的作用。 領導這一研究的是康奈爾大學威爾醫學院前結構生物學家、現任職波士頓兒童醫院的吳浩(Hao Wu)教授和麻