天津工生所等構建出新型基因組隨機突變系統
與傳統的定向進化相比，體內連續進化的研究仍處在較初級的階段。目前僅在大腸桿菌或釀酒酵母等模式微生物底盤中構建出了體內連續進化系統，而這些系統本身存在局限，體內連續進化技術還需進一步的發展和完善，以滿足更廣泛的需求。 中國科學院天津工業生物技術研究所研究員張學禮帶領的微生物代謝工程團隊、研究員畢昌昊帶領的合成生物技術研究團隊，與大連工業大學教授張春枝和天津師范大學教授李菊帶領的團隊合作，共同設計構建出一種新型的基因組隨機突變系統：Helicase-AID。該系統將DNA解旋酶與胞嘧啶脫氨酶（AID）融合，形成酶復合物。在大腸桿菌和釀酒酵母基因組水平的隨機突變相對于野生型突變效率分別提高2.5×103倍和1.68×103倍。此外，研究發現Helicase-AID在大腸桿菌中的隨機突變與DNA復制高度協調。由于解旋酶在真核生物中高度保守，因此Helicase-AID可應用于各種真核細胞。 研究人員將Helicase-AID進一......閱讀全文
天津工生所等構建出新型基因組隨機突變系統
與傳統的定向進化相比，體內連續進化的研究仍處在較初級的階段。目前僅在大腸桿菌或釀酒酵母等模式微生物底盤中構建出了體內連續進化系統，而這些系統本身存在局限，體內連續進化技術還需進一步的發展和完善，以滿足更廣泛的需求。 中國科學院天津工業生物技術研究所研究員張學禮帶領的微生物代謝工程團隊、研究員畢
天津工生所等構建出新型基因組隨機突變系統
與傳統的定向進化相比，體內連續進化的研究仍處在較初級的階段。目前僅在大腸桿菌或釀酒酵母等模式微生物底盤中構建出了體內連續進化系統，而這些系統本身存在局限，體內連續進化技術還需進一步的發展和完善，以滿足更廣泛的需求。 中國科學院天津工業生物技術研究所研究員張學禮帶領的微生物代謝工程團隊、研究員畢
基因組所人類基因組突變研究獲進展
序列變異的周期性和與TCR相關聯的突變 基因突變會導致人類疾病的產生，因此研究遺傳變異的產生過程和那些能夠引起疾病的突變對生命科學基礎研究以及人類健康是十分關鍵和重要的。 近日，中國科學院北京基因組研究所于軍研究員帶領其研究團隊，在有關人類基因組中以轉錄為中心的突變研究方面取得新進展
點突變不易擴增突變系統（簡稱ARMS)分析實驗
實驗材料 正常 ARMS 引物 突變 ARMS 引物共 同（普通）引物試劑、試劑盒 4dNTP10 X PCR 反應緩沖液已知基因型 DNA 模板輕礦物油Taq DNA 聚合酶loading緩沖液DNA 分子大小標記DNA 樣本儀器、耗材 Perkin-Elmer Cetus thermal cyl
點突變不易擴增突變系統（簡稱ARMS)分析實驗
實驗材料正常 ARMS 引物突變 ARMS 引物共 同（普通）引物試劑、試劑盒4dNTP10 X PCR 反應緩沖液已知基因型 DNA 模板輕礦物油Taq DNA 聚合酶loading緩沖液DNA 分子大小標記DNA 樣本儀器、耗材Perkin-Elmer Cetus thermal cyler (
AI揭示影響人腦發育基因組突變
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494310.shtm 科技日報北京2月21日電?（記者張夢然）美國研究人員使用人工智能（AI）模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法
AI揭示影響人腦發育基因組突變
科技日報北京2月21日電 美國研究人員使用人工智能（AI）模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法。該研究發表在新一期的《科學進展》上。 認知是人類進化的一個決定性特征，使人類有別于其他靈長類動物。盡管自人類與黑猩猩分道揚鑣以來發生
單細胞基因組突變檢測新突破
愛因斯坦研究人員已經開發并驗證了一種準確識別單細胞基因組中突變的方法。這種新方法可以幫助預測癌癥是否將在看似健康的組織中發展，在今天的自然方法的在線版本中發表的論文中被描述。相應的作者是Lola和Saul Kramer分子遺傳學主席Jan Vijg博士。 在科學家可以分析單個細胞的基因組之前，
定義癌癥突變：破壞基因組3D相互作用的突變
在細胞中，DNA緊密地包裹在蛋白質周圍，并以一種復雜的3D結構包裝，我們稱它們為“染色質”。染色質不僅可以保護我們的遺傳物質不受損傷，而且通過調節基因組在3D空間的表達來組織整個基因組：展開呈現給細胞基因表達機器，然后再將它們卷回去。 在3D染色質結構中，一些區域被稱為“拓撲關聯域（TADs）
PNAS：利用CRISPR/Cas9開發出一種精準的基因組突變預防系統
通用的DNA遺傳編碼中的單個堿基變化可導致或惡化許多危及生命的疾病。這種“點突變”能夠將人體內的細胞轉變為癌細胞，隨后這種癌細胞繼續生長而形成腫瘤，或者它們能夠將將抗生素敏感性細菌轉化為導致不可治愈的感染的抗生素耐藥性細菌。在理想的世界中，臨床醫生應能夠在攜帶著這樣的有害點突變的細胞產生后立即將
PNAS：利用CRISPR/Cas9開發出一種精準的基因組突變預防系統
通用的DNA遺傳編碼中的單個堿基變化可導致或惡化許多危及生命的疾病。這種“點突變”能夠將人體內的細胞轉變為癌細胞，隨后這種癌細胞繼續生長而形成腫瘤，或者它們能夠將將抗生素敏感性細菌轉化為導致不可治愈的感染的抗生素耐藥性細菌。在理想的世界中，臨床醫生應能夠在攜帶著這樣的有害點突變的細胞產生后立即將
證實基因組測序成功鑒定癌癥相關突變
最近，UT西南醫學中心的癌癥研究人員表明，全基因組測序可以用來確定患者遺傳性癌癥的風險，這可能會促進癌癥的預防、診斷和護理。 這項研究首次采用全基因組測序來評估258名癌癥患者的基因組，以提高癌癥誘發突變的診斷能力。相關研究結果發表在12月份的國際期刊《EBioMedicine》。 UT西南
全基因組突變新技術原理簡介
人類遺傳圖譜中，基因只占了全部DNA的2.5％，基因與基因之間的“非編碼”大片段并不全是“垃圾”，有些能夠調節基因的開啟和關閉，有些負責DNA折疊和將DNA打包運往細胞核。不止基因突變，控制基因的DNA發生突變也可能導致疾病。小鼠是疾病研究的常用模型，想要弄清小鼠基因組中每個DNA片段的功能，需要依
Nature：全基因組測序重新定義癌癥之王基因組突變藍圖
近日，一項發表于國際著名雜志Nature上的研究論文中，來自英國和澳大利亞的研究人員對100位胰腺癌患者癌癥組織的基因組進行了深入分析，結果發現了4種不同的亞型，這或許可以幫助后期開發治療胰腺癌患者的新型療法。文章中研究人員利用全基因組測序技術揭示了腫瘤基因組結構性改變的光譜模式，該技術可以幫助
為什么僅僅通過NGS來測基因組突變...
Illumina最近的一個大動作就是投入一億美金，分出一部分骨干，成立一個以“液態活檢”為中心的公司。所謂液態活檢，就是不用組織穿刺，通過 血液，尿液這類非侵犯性取才得來的標本對疾病進行診斷和評估。液態活檢是精準醫療的重要組成部分，試圖在血液里找到腫瘤細胞，或腫瘤DNA，通過高通量測 序
全基因組測序揭示肝癌相關基因突變
由亞洲癌癥研究組織(ACRG)、深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細胞癌相關的基因突變研究成果于2013年6月20日在《基因組研究》(Genome Research)雜志上發表。這是繼2012年3月份在《自然-遺傳學》上發表的乙肝病毒整合機制研究之后，該研究團隊在肝癌研究中所取得的又
Nat－Commun：揭示引發食管癌的基因組突變
近日，來自澳大利亞昆士蘭大學的研究人員通過研究發現，意外的染色體突變或許會誘發食道癌的發生，相關研究發表于國際雜志Nature Communications上。研究者Nic Waddell表示，本文中我們對來自三所布里斯班醫院的22名患食管腺癌(OAC)的進行了全基因組測序研究分析，結果顯示，在
Nature：系統解析斑馬魚參考基因組
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
“基因魔剪”有了脫靶突變檢測系統
據英國《自然》雜志9月12日在線發表的一項基因編輯學研究，歐洲與美國科學家團隊報告稱：針對CRISPR-Cas9基因組編輯的全基因組脫靶效應的高效檢測系統，在小鼠身上完成了測試。該研究成果將促進基因組編輯從研究到臨床的轉化。 CRISPR-Cas9基因組編輯技術有“基因魔剪”之稱，被認為是人類
基因組分析證實：突變頻率越高物種壽命越短
科技日報北京4月19日電 （實習記者張佳欣）這是一個困擾科學家多年的謎團——為什么不同的動物有如此不同的壽命？人類可以活到80歲左右，而長頸鹿往往在24歲時死亡，裸鼴鼠的成年個體只有長頸鹿的兩萬三千分之一，但它可活到25歲。這表明，除了體型之外還有其他原因影響壽命。近日發表在《自然》雜志上的一項研究
EBioMedicine：全基因組測序高效識別癌癥相關基因突變
UT西南醫學中心癌癥研究人員已經證明，全基因組測序可用于識別癌癥的遺傳性風險，其可以潛在地改善癌癥的預防，診斷和治療。 這是首次研究使用了全基因組測序以評估一系列258癌癥患者的基因組，診斷其癌癥傾向性突變情況。這項研究發表在雜志EBioMedicine上。全基因組測序是新的基因工具，能夠確定
對環境致癌物進行全基因組測序－揭示突變特征
對人類腫瘤進行全基因組測序（whole-genome-sequencing, WGS）可顯示出獨特的突變模式，這些突變模式有助于揭示癌癥的病因。 在一項新的研究中，來自英國劍橋大學、倫敦國王學院和韋爾科姆基金會桑格研究所的研究人員對324種暴露于79種已知或潛在的環境致癌物的人誘導性多能干細胞
新CRISPR系統為基因組編輯帶來了希望
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/513047.shtmCRISPR-Cas9最著名的功能是作為編輯DNA的實驗室工具，但它的自然功能是作為免疫系統的一部分，幫助某些微生物對抗病毒。 ???CRISPR-Cas9系統(如圖)用于發
“基因組規模系統代謝育種”項目取得重要進展
微生物制造技術在降低環境污染、促進可再生資源替代化石資源方面有著良好的發展前景。而我國微生物制造產業水平與國際差距明顯，主要原因在于工業菌種水平低下，某些重要的氨基酸、化工醇等產品長期依賴進口。發展微生物的基因組規模系統代謝育種技術改造工業菌種，是加速我國工業菌種性能提升的重要前提。 由安徽
基因組系統解析工具開發研究取得重要進展
近日，中國工程院院士、南方海洋科學與工程廣東省實驗室（廣州）教授包振民團隊開發國際首個整合宏觀/微觀進化基因組和功能基因組的綜合分析工具（PanSyn，https://github.com/yhw320/PanSyn）。相關成果發表于《自然-實驗手冊》。該成果是包振民團隊長期積累的豐富基因組學分析方
精確基因組學指出了與加速衰老相關的突變
明尼蘇達州羅切斯特 ?--Mayo Clinic的研究人員正在使用精確基因組學來尋找尚未發現的可遺傳的加速衰老的基因突變。 在最近發表于Mayo Clinic Proceedings,的一項研究中，研究人員進行了一項評估17例短端粒綜合征患者的研究 ?--這是一種導致未成熟DNA以及細胞惡化的
Nature子刊公布癌癥基因組研究重要成果：新的遺傳突變
在一項多達10萬人（包括17,000名最常見類型的卵巢癌患者）的遺傳分析研究中，研究人員確定了12種新的增加卵巢癌患病風險的遺傳變異，并找到了它們與以前發表的18種變異之間的關聯。 這項研究成果公布在3月27日的Nature Genetics雜志上，由OncoArray Consortium聯
科學家繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜
體細胞突變是腫瘤發生的標志，可用于癌癥的無創診斷。美國約翰·霍普金斯大學醫學院繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜，用于癌癥無創檢測。該研究成果于近日發表在《Nature Genetics》雜志上，題為：Single-molecule genome-wide mutation profile
中國團隊發現：吸煙可引起癌旁正常肺組織基因組突變
吸煙及空氣污染是目前全球面臨的兩個主要公共健康問題，均可引起人體基因組突變而導致疾病發生。全球每年有182萬新發肺癌病例，死于肺癌者達159萬人。85%的肺癌是由吸煙所引起，空氣污染則每年引起22萬新發肺癌病例。為揭示肺癌發生的機理，研究人員往往利用癌旁正常肺組織作為對照，剖析肺癌基因組發生的異
北大、加大等聯手探索斑馬魚全基因組突變新技術
來自北京大學生命科學學院、美國國立人類基因組研究所和加州大學生物系的研究人員，最近在利用逆轉錄病毒插入法引發斑馬魚全基因組范圍內基因突變的研究中取得重大進展。文章刊登于7月18日在線版《PNAS》。 研究人員采用其研制的一組技術，用假性逆轉錄病毒（pseudotyped retroviruses）