利用454技術進行結核桿菌全基因組測序有效追蹤疫情傳播
眾所周知，肺結核多數是由結核分枝桿菌感染肺部引起的肺部感染性疾病，已成為一個嚴重威脅人類健康的疾病。世界衛生組織(WHO)統計表明，全世界每年發生結核病800～1000萬，每年約有300萬人死于結核病，是造成死亡人數最多的單一傳染病。1993年WHO宣布“全球結核病緊急狀態”， 認為結核病已成為全世界重要的公共衛生問題。我國是世界上結核疫情最嚴重的國家之一。 然而細菌也一直處于不斷突變及進化的過程中，要對癥下藥就需要知道細菌的準確分型。傳統的細菌分型技術僅針對細菌的某幾個基因進行檢測，在傳染病疫情爆發時往往缺乏更具體的信息，于是在全基因組測序費用不斷下降的現在，研究者們也在嘗試用新一代的檢測技術對細菌進行分型，以發現傳染病爆發的傳播模式和幾率。 近期，據《PLoS Medicine》雜志報道，有研究者們利用454技術對86例人結核分枝桿菌進行了全基因組測序，并與傳統分型技術結果進行了比較。這86例細菌是從......閱讀全文
利用454技術進行結核桿菌全基因組測序有效追蹤疫情傳播
眾所周知，肺結核多數是由結核分枝桿菌感染肺部引起的肺部感染性疾病，已成為一個嚴重威脅人類健康的疾病。世界衛生組織(WHO)統計表明，全世界每年發生結核病800～1000萬，每年約有300萬人死于結核病，是造成死亡人數最多的單一傳染病。1993年WHO宣布“全球結核病緊急狀態”， 認為結核病已
454用于西紅柿基因組測序
最近，西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜，以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜，并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較，尋找與水果有些特性相關的基因，相關文獻在Nature雜志作為封面文章發
PNAS：全基因組測序鑒定非洲結核桿菌病原體早期感染
最近，發表在PNAS的一項研究檢查了南非地區爆發的廣泛耐藥結核病流行株LAM4 / KZN的進化和流行病學歷史。 該菌株首次報道于2005年在夸祖魯-納塔爾省的圖格拉渡輪，此后已在全省廣泛傳播。這項新研究確定了促進XDR-TB菌株疫情爆發的關鍵宿主，病原體和環境因素，以及可以采取的早期發現和遏
全基因組測序鑒定非洲結核桿菌病原體早期感染情況
最近，發表在《PNAS》雜志上的一項研究檢查了南非地區爆發的廣泛耐藥結核病流行株LAM4 / KZN的進化和流行病學歷史。 該菌株首次報道于2005年在夸祖魯-納塔爾省的圖格拉渡輪，此后已在全省廣泛傳播。這項新研究確定了促進XDR-TB菌株疫情爆發的關鍵宿主，病原體和環境因素，以及可以采取的早
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA，解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本，不會造成偏差，擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w
利用454技術解析樣本中病毒耐藥突變情況
H7N9是一種甲型流感病毒，是禽流感病毒的一個亞型，1988年在美國火雞身上有了第一個病毒記錄。H7N9原本屬于低致病性感冒病毒，經基因交換后轉移到人類上感染后成為病發期短、重癥率與死亡率較高的傳染性病毒。自今年3月下旬開始，人類感染甲型流感病毒H7N9的病例陸續在上海及長江三角洲一帶的城市被發現。
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明，白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
結核桿菌檢測有了新技術
陽性檢出率從25%提高到60%以上 中南大學湘雅醫院專家發明的液基夾層杯法抗酸桿菌檢驗技術，使結核病菌的陽性檢出率從25%提高到60%以上。該院最近運用這項新技術，首次在疑似結核性腦膜炎患者的腦脊液中發現結核分枝桿菌。 專家介紹，以往結核病確診試驗主要有兩種方法，即傳統的痰涂片和痰培養，這也是
PCR技術應用十二：結核桿菌診斷
結核桿菌可以導致全身性疾病，特別是在發展中國家，其發病率較高，危害性極大.近幾年結核桿菌的變異性較大，對抗癆藥物的耐藥性增加，從而使結核病的發病大幅度增高.雖然傳統的涂片抗酸染色、細菌培養以及胸片檢查對大部分結核能作出正確的診斷，但對某些病人亦可造成誤診或漏診;動物接種雖特異性較高，但因時間較長
簡述全基因組測序的技術路線
全基因組測序的技術路線：提取基因組DNA，然后隨機打斷，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接頭, 進行DNA簇（Cluster）制備，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法對插入片段進行測序。然后對測得的序列組裝成Contig，通
454測序參與棉花基因組進化研究工作
棉花是全球重要的經濟作物之一。它的纖維，俗稱皮棉，是紡織工業主要的天然原料。全世界棉花種植面積約5億畝，我國常年種植面積近8千萬畝。棉花不但是重要的纖維和油料植物，而且是重要的植物蛋白來源。在食用油中，棉籽油的亞油酸含量最高，達到55.6%。除此以外，棉花種子中還含有極為豐富的蛋白質和脂肪等物質
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
線粒體全基因組測定揭示家雞馴化史
為探討家雞的馴化歷史，中科院昆明動物研究所的研究人員發現了家雞較為清晰的母系遺傳背景信息。該研究成果日前在線發表于國際期刊《遺傳》。 據介紹，從肉蛋供應到供人娛樂，家雞在人類生產生活中扮演著重要角色。在被馴化之后，家雞跟隨人類擴散到世界各地，成為飼養最為廣泛的家禽。而家雞的馴化問題，自達爾
結核桿菌發生基因突變后毒性超強
美國加利弗尼亞大學的一項研究結果表明，使結核桿菌的一組基因失活而產生的突變型病原體竟然導致其增殖加快并具有更高的致死力。感染突變株兩周后小鼠器官內的結核桿菌（TB）數量遠多于感染野生型TB者，27周后感染了突變株的小鼠開始死亡，而另一組感染了野生型TB的小鼠在感染41周后仍然存活。該研究發表于12月
印度繪制出結核桿菌基因組圖譜
印度科學與工業研究理事會會長布拉姆哈查里近日宣布，印度研究人員成功繪制出了結核桿菌的基因組圖譜，這將有助于研發有效治療結核病的新型藥物。 綜合當地媒體報道，來自印度全國的數百名研究人員參與繪制出了包含4000個基因的結核桿菌基因組圖譜。 據悉，印度將在互聯
植物全磷、全氮、全鉀的測定
一、植物全氮測定（一）H2SO4-H2O2消煮法1、適用范圍本方法不包括硝態氮的植物全氮測定,適合于含硝態氮低的植物樣品的測定。2、方法提要植物中的氮、磷大多數以有機態存在,鉀以離子態存在。樣品經濃H2SO4和氧化劑H2O2消煮,有機物被氧化分解,有機氮和磷轉化成銨鹽和磷酸鹽,鉀也全部釋出。消煮液經
全基因組突變新技術原理簡介
人類遺傳圖譜中，基因只占了全部DNA的2.5％，基因與基因之間的“非編碼”大片段并不全是“垃圾”，有些能夠調節基因的開啟和關閉，有些負責DNA折疊和將DNA打包運往細胞核。不止基因突變，控制基因的DNA發生突變也可能導致疾病。小鼠是疾病研究的常用模型，想要弄清小鼠基因組中每個DNA片段的功能，需要依
Roche－454（GS－FLX－Titanium－System）超高通量測序技術原理
Roche 454（GS FLX Titanium System）超高通量測序技術原理2005年底，454公司推出了革命性的基于焦磷酸測序法的超高通量基因組測序系統——Genome Sequencer 20 System，被《Nature》雜志以里程碑事件報道，開創了邊合成邊測序的先河。2007
小鹽芥全基因測定拉開耐鹽植物研究序幕
小鹽芥是一種生長在鹽堿地的植物，開著芝麻粒兒大小的白色花兒，既沒牡丹的華麗，也無荷花的清香，很難入普通人的法眼。但最近幾年，它卻得到了生物學家的垂青，成為全球近百個生物實驗室競相研究的對象。悄無聲息中，這種普通的野草儼然已成為一朵盛開的奇葩。 7月9日，它登上了《美國科學院院刊》(PNAS
科學家完成辣椒全基因組序列測定
由我國科技人員主導完成的“栽培種和野生種辣椒的全基因組測序揭示辣椒屬的馴化與特異性”研究論文，今年3月在國際著名期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)刊發。該論文的正式發表，標志著辣椒基因組序列成功解碼，我國辣椒基礎性研究取得重大進展，進入分子育種階段。 美國農藝學會主席、新墨西哥州立大學
DNA測序儀：454測序儀
454測序儀的出現極大促進了測序業務的開展，科研人員已經將測序技術作為解決科研工作中許多常見 問題的利器。這是因為454測序儀在以下幾個方面取得了質的突破：首先是解決了高通量測序問題；其次它簡 化了樣品準備步驟，將以往轉化大腸桿菌擴增質粒的繁瑣過程全部用簡單的體外PCR擴增法替代了；最后， 它縮小了
羅氏454測序用于野生雙峰駝基因組圖譜繪制
中國及中亞細亞溫帶荒漠地區的駱駝均為雙峰駱駝(Bactrian camel)，中國的雙峰駝集中分布于內蒙古西部、寧夏、新疆、甘肅的溫帶荒漠和荒漠草原區，占全國總駝數的95%。且中國尚有數量比大熊貓還少的世界珍稀瀕危動物―野生雙峰駝存在。內蒙古阿拉善盟是中國駱駝最多的地區，擁有雙峰駝10萬峰以
單細胞全基因組擴增技術大比武
2013年，權威技術期刊《Nature Methods》將年度技術授予了單細胞測序。正如社論中所說，每個細胞都是獨一無二的--它占據了獨特的空間位置，它的復制基因組中攜帶了獨特的錯誤。然而，過去以細胞群體為對象的研究只獲得了平均值，而忽略了異質性。目前多種新型分析技術，如NGS，都是為細胞群
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
全基因組甲基化定量檢測技術ＬＵＭＡ
LUMA介紹 基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件，有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此，我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化，稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methyl
全基因組甲基化定量檢測技術ＬＵＭＡ
LUMA介紹基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件，有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此，我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化，稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methylat
全硫的測定
煤中全硫的測定采用艾氏卡法、庫侖法和高溫燃燒中和法，適用于裼煤、煙煤、無煙煤。在仲裁分析時，應采用艾氏卡法。73.11.5.1 艾氏卡法方法提要將煤樣與艾氏卡試劑混合灼燒，煤中硫生成硫酸鹽，然后使硫酸根離子生成硫酸鋇沉淀，根據硫酸鋇的質量計算煤中全硫的含量。試劑艾氏卡試劑 以 2 份質量的化學純輕質
土壤全氮測定
土壤全氮的測定技術和方法，儀器:控溫電爐,消煮管, 定氮儀蒸餾器、消化爐 試劑:1. 硫酸（GB 625—77）：化學純；2. 硫酸（GB 625—77）或鹽酸（GB 622—77）：分析純，0.005mol/L硫酸或0.01mol/L鹽酸標準溶液；3. 氫氧化鈉（GB 629—81）：工業用或化學
益生乳酸菌全基因組序列測定完成
內蒙古農業大學正式公布,益生乳酸菌的全基因組序列測定分析全部完成,這是我國第一個完成的乳酸菌基因全序列測定。 由內蒙古農業大學“乳品生物技術與工程”教育部重點實驗室主持進行的益生乳酸菌的全基因組序列測定Lb.casei Zhang科技項目是經過6年分離、篩選,并進行系統研究開發的具有完全自主知識產