華南植物園關于植物轉錄起始調控機制的研究獲進展
轉錄復合體將DNA轉錄為RNA，是遺傳信息由細胞核向細胞質轉遞的基礎。由于核小體與基因組的緊密結合，轉錄復合體需克服核小體障礙進而確保功能基因的表達。染色質重塑復合體（Chromatin Remodeler）被認為在轉錄過程中發揮了重要作用。這類蛋白復合體能通過水解ATP來調控核小體的組成和分布，從而為轉錄復合體在DNA上組裝創造松散的染色質環境。那么染色質重塑復合體如何判定基因的激活狀態并精確與之結合呢？其次，近些年對植物轉錄的研究發現，植物的轉錄起始呈現出與酵母和動物細胞不同的特征，如：轉錄起始位點呈現的單向轉錄（酵母和動物細胞為雙向轉錄）；植物中存在明顯的近端啟動子停滯（promoter-proximal pausing）但卻缺少與動物同源的參與調控pausing的蛋白因子；真核生物中保守的轉錄延伸因子SPT6，在植物中能結合到轉錄起始位點參與轉錄起始等。這些差異表明了植物轉錄起始的獨特性，而植物轉錄起始的分子機制尚不......閱讀全文
武漢植物園在蓮NAC轉錄因子研究中獲進展
NAC轉錄因子是植物特有的一類轉錄因子，廣泛存在于植物界，并參與調節植物的各種生物學過程，例如器官發生、組織發育以及脅迫應答響應等。然而，蓮中NAC轉錄因子家族尚未報道。 近日，Frontiers in genetics發表了中國科學院武漢植物園蓮種質資源與遺傳育種學科組撰寫的題為Genome
中科院植物所發現果實成熟的轉錄后調控機制
日前，中科院植物所研究員田世平小組的一項研究為解析果實成熟和抗病反應的轉錄后調控機制提供了依據。相關成果在線發表于《基因組生物學》雜志。 研究人員對液泡加工酶編碼基因SlVPE3在番茄果實成熟中的功能進行了研究。通過RNAi技術沉默SlVPE3后，發現番茄果實成熟期明顯推遲，且果實對病原菌更敏
植物所揭示萊茵衣藻m6A表觀轉錄組圖譜
m6A是廣泛存在于真核生物mRNA中的表觀修飾，與RNA命運相關。近年來，m6A修飾在植物胚胎發育、莖尖分生組織的命運決定、表皮毛發生、根部發育、葉形態發生、開花轉變、脅迫響應、果實成熟及孢子發生等多個生物學過程中發揮重要功能。然而，m6A在藻類中的功能尚不清楚。藻類包含從單細胞到多細胞的多種細
劉勛成等研究揭示植物光響應基因轉錄調控機理
近日，中科院華南植物園的一項研究揭示了植物光響應基因轉錄調控新機理，為農作物高產育種提供了重要的理論基礎。相關研究發表在《植物細胞》上。 在高等植物中，光敏色素通過與一類bHLH轉錄因子——光敏色素互作蛋白(PIFs)相互作用、傳遞光的信號從而影響植物的生長發育。然而，對光敏色素互作蛋白如
酸式滴定管起始讀數怎么讀起始讀數在0刻度以下
因為酸式滴定管和堿式滴定管的零刻度線在上方，越往下走讀數越大。所以要從上至下開始讀數。而其它儀器零刻度線一般在下方，越往上走，讀數越大，所以要從下至上開始讀數。常量分析用的滴定管有50mL及25mL等幾種規格，它們的最小分度值為0.1mL，讀數可估計到0.01mL。此外，還有容積為10mL，5mL，
遺傳發育所解析茉莉酸調控植物免疫的轉錄重編程機理
茉莉酸是來源于不飽和脂肪酸的植物免疫激素，其生物合成途徑和化學結構與高等動物中的免疫激素前列腺素有極高的類似性。在受到機械傷害、咀嚼式昆蟲和死體營養型病原菌的侵害時，植物激活茉莉酸信號通路，啟動并級聯放大茉莉酸介導的轉錄重編程，從而產生有效的防御反應。但目前對茉莉酸激活植物免疫轉錄重編程的機理所
跨學科合作將成為解碼植物表觀轉錄組的加速器
近日，中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所教授呂培濤在《生物技術通報（英文）》（aBIOTECH）發表了綜述論文。文章系統闡述了RNA修飾在植物生命活動中的調控作用，深入解析了N6—甲基腺苷（m6A）等修飾對植物發育及果實成熟的分子機制。 真核生物RNA上存在170多種化學修飾，形成動態可逆的
植物所在大豆種子大小馴化轉錄組進化研究中取得進展
栽培大豆（Glycine max）是由其近緣種野大豆（Glycine soja）馴化而來。栽培大豆和野大豆果實發育過程中基因的差異表達可能影響種子大小，參與大豆種子的馴化。然而，大豆馴化的遺傳變異基礎尚不清楚。 中國科學院植物研究所賀超英研究組針對大豆種子大小馴化開展了轉錄組比較研究。研究人員
遺傳發育所解析茉莉酸調控植物免疫的轉錄重編程機理
茉莉酸是來源于不飽和脂肪酸的植物免疫激素，其生物合成途徑和化學結構與高等動物中的免疫激素前列腺素有極高的類似性。在受到機械傷害、咀嚼式昆蟲和死體營養型病原菌的侵害時，植物激活茉莉酸信號通路，啟動并級聯放大茉莉酸介導的轉錄重編程，從而產生有效的防御反應。但目前對茉莉酸激活植物免疫轉錄重編程的機理所
研究發現植物葉綠體基因組可以全部轉錄的新機制
葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能、供給地球上的其它生物能量來源的重要細胞器，對葉綠體的功能和葉綠體基因組轉錄機制的研究一直以來是全球細胞生物學家、遺傳學家和分子生物學家孜孜以求的研究熱點。中國科學院昆明植物研究所研究員高立志帶領的研究團隊，歷時五年，通過對三種高等植物（水稻、玉米和擬南芥
起始復合物的結構功能
由一個mRNA、一個接合子mRNA的特定位點（RBS；核糖體結合位點）的30s核糖體亞基和一個與起始密碼子相互作用的N-甲酰甲硫氨酸tRNA相結合而成。某些蛋白質（起始因子）也為起始復合物貢獻信息，然后被快速釋放。
起始密碼子的運作原理
AUG是起始密碼子，也就是說肽鏈起始于甲硫氨酸。這個氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密碼子結合到一個與甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密碼子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上．也就是說，甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG編碼．但是起始氨基酸的信號要比所有其他氨基酸的信號復雜得多。根
什么是上游起始密碼子？
約50%的智人（Homo Sapiens）基因帶有上游起始密碼子（上游AUG）。盡管真核細胞每條mRNA只表達一個蛋白，但其依然可以帶有多個上游可讀框和上游AUG，只是其并不翻譯產生具有生物學意義的蛋白。理論上，真核細胞會翻譯其mRNA上游到下游掃描遇到的第一個AUG，并且在翻譯完成后解離。這意味著
起始tRNA－的結構和功能特點
起始tRNA initiation tRNA是指能特異性地認別mRNA上的起始密碼子，是使蛋白質合成開始的tRNA。在細胞中有兩種甲硫氨酸tRNA分子，其中的一種就起這種作用。在大腸桿菌中，已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后，以其30S核糖體亞基與mRNA共同結合，使蛋白質合成開始。即使
類器官培養的起始細胞來源
類器官培養的起始細胞群一般從成人或胎兒組織活檢樣本中獲得，腫瘤組織也可類似處理以分離腫瘤細胞來培養類器官。此外，從外周血、腹水和胸腔積液等液體樣本中分離的腫瘤細胞也可作為起始材料。對于腫瘤衍生類器官，需要解決癌細胞和正常細胞共存的問題，可利用培養條件，通過使用選擇性培養基來實現。
原核細胞的翻譯起始過程介紹
（1）翻譯起始因子IF3結合到小亞基的E位點，同時也橫跨至P位點；（這一過程在起始之初就已經完成）起始因子IF1結合至A位點； （2）起始因子IF2·GTP被IF3和IF1招募至P位點； （3）起始fMet·tRNA一方面被mRNA起始密碼子AUG招募，另一方面被已經結合到P位點的IF2·G
真核起始因子的相關疾病
已知的真核起始因子中，eIF2B與人類遺傳病的關系最為密切。eIF2B的五個亞基基因的常染色體遺傳性隱性突變會導致白質異常，在臨床上表現為一系列嚴重的連續癥狀，稱為“eIF2B相關紊亂”。典型的如腦白質病，即白質消失（vanishing white matter，VWM）和卵巢衰竭（ovaria
脂肪酸合成的起始原料
脂肪酸合成的起始原料是乙酰coa，它主要來自糖酵解產物丙酮酸，脂肪酸的合成是在胞液中。先說說飽和脂肪酸的合成：1.乙酰輔酶a的轉運：脂肪酸的合成是在胞液中，而乙酰coa是在線粒體內，它們不能穿過線粒體內膜，需通過轉運機制進入胞液。三羧酸循環中的檸檬酸可穿過線粒體膜進入胞液，然后在檸檬酸裂解酶的作用下
關于基因轉錄的轉錄因子介紹
轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態，RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄，只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后，基因才開始表達。轉錄因子的結合位點
轉錄圖譜的轉錄圖譜的意義
在于它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以了解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達；也可以了解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達，還可以了解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。人類基因組是一個國際合作項目：表征人類基因組，選擇的模式生物的D
RNA的轉錄和逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
RNA復制、轉錄與逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
版納植物園擬南芥WRKY57轉錄因子研究獲進展
植物葉片衰老受到多種發育因子和環境因子所調控。外源植物激素茉莉酸(JA)處理可以誘導葉片細胞迅速進入衰老程序，而生長素(Auxin)卻可以有效地抑制該過程發生。眾所周知，植物激素JA和auixn介導的信號途徑之間存在著交叉調控通路，并在植物發育和抵抗病原菌侵染等生理過程中發揮著重要調控功能。但是
武漢植物園等長鏈非編碼RNA調控基因轉錄研究獲進展
長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指長度大于200個核苷酸的非編碼RNA，目前已在多種生物中發現了大量lncRNA，然而只有少數lncRNA的精細作用機理被闡明。 中國科學院武漢植物園汪志偉博士在植物種群遺傳學科組王艇研究員支持和中國科學院留學
版納植物園轉錄調控因子Alfinlike基因家族研究獲進展
通過比較基因組學，在基因組層次上研究特定基因家族的進化，進而揭示其變化的原因和機制，已成為目前進化生物學關注的熱點問題。中科院西雙版納熱帶植物園生態進化生物學研究組研究人員利用模式植物擬南芥(Arabidopsis thaliana)及其近緣物種琴葉擬南芥(A. lyrata)和小鹽芥(Th
Nucleic－Acids－Research：ECF－σ因子的σ2/σ4－linker區域的結構與功能
5月27日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表了中國科學院分子植物卓越創新中心/植物生理生態研究所合成生物學重點實驗室張余研究組題為Structures and mechanism of transcriptioninitiation by bacterial
轉錄因子的轉錄調控區的介紹
同一家族的轉錄因子之間的區別主要在轉錄調控區。 轉錄調控區包括轉錄激活區（transcription activation domain）和轉錄抑制區（transcription repression domain）二種。近年來，轉錄的激活區被深入研究。它們一般包含DNA結合區之外的30-10
關于體外轉錄的轉錄條件介紹
轉錄模板必須滿足： 1. 在基因組全長克隆過程中，在正向引物5‘末端添加T7啟動子序列； 2. 以T7啟動子作為體外轉錄啟動子，在啟動子后面靶位序列連續帶有3個G,轉錄效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一個帽子G,有利于提高體外轉錄RNA分子的侵染活性。
cDNA文庫注意獲得起始RNA的介紹
構建cDNA文庫要求的RNA量比做RACE和Northern blot的要多，在材料允許的情況下一般的試劑盒均推薦采用純化總mRNA后進行反轉錄，這比直接采用總RNA進行反轉錄而構建的cDNA文庫好，雖然后者也并不是不能做。老版本CLONTECH的SMART 4的中級柱子要求純化后的總mRNA量
真核起始因子的相互作用
真核起始因子之間與核糖體之間存在著大量的相互作用，構成了一個相互作用網絡。其中，eIF3是介導這一相互作用網絡的中心點，它的一個或多個亞基可以與eIF1、eIF1A、eIF2、eIF4B、eIF4G、eIF5以及核糖體40S亞基相互作用。這些相互作用可能是穩定的，從而可以形成穩定的復合物參與翻譯