上科大水雯箐博士：DIA常用軟件及分析流程|WeOmicsG21
“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研討會 由西湖大學Guomics實驗室，西湖實驗室iMarker實驗室，CN-HUPO，The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同舉辦，并由西湖歐米承辦，SCIEX協辦。本期研討會主題：DIA常用軟件及分析流程直播時間：2023年2月9日（周四）7:00-8:30 PM 北京時間6:00-7:30 AM EST微信搜索“人類蛋白質組計劃”視頻號預約關注報告專家：水雯箐，Wenqing Shui，上海科技大學生命科學與技術學院、iHuman 研究所，研究員Professor, ShanghaiTech University討論嘉賓：申華莉，Huali Shen，復旦大學生物醫學研究院研究員，博士生導師Professor, Institute of Biome......閱讀全文
上科大水雯箐博士：DIA－常用軟件及分析流程－|－WeOmics－G21
“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研討會?由西湖大學Guomics實驗室，西湖實驗室iMarker實驗室，CN-HUPO，The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同舉辦，并由西湖
上科大蛋白質組學研究揭示抑郁行為的新調控因子
大腦是生物體內結構和功能最復雜的組織。近年來蓬勃發展的腦蛋白組學研究是繪制大腦功能分子圖譜、全面理解大腦生理病理機制的必經途徑。跨膜蛋白家族在突觸信號傳遞和神經可塑性調節中扮演重要角色，許多跨膜蛋白與精神類疾病和神經退行性疾病的發生發展密切相關。然而對動物組織中跨膜蛋白家族的組學解析仍面臨巨大的
天津工生所揭示工業酵母長時高溫耐受機制
人們對模式生物釀酒酵母在諸如熱擊等不同環境壓力下的應答已做了許多組學層面上的研究，然而，目前還未見對工業釀酒酵母特殊的高溫耐受性狀進行系統生物學研究的報道。 近日，中國科學院天津工業生物技術研究所王欽宏研究組與水雯箐研究組合作，通過全細胞蛋白質組學策略，研究適應性進化獲得的工業酵母菌株的高溫耐
國博迎來一位特殊的職員——數字虛擬人“艾雯雯”
7月22日，一位年輕的“女孩”正式入職中國國家博物館（以下簡稱國博），成為國博的一名特殊的新員工。她叫艾雯雯，是一名虛擬數字人。她“出生”于2000年5月4日，雖然才22歲，但是她已經擁有了豐富的知識儲備和講解技能，甚至熟知國博文物珍品的具體信息。 此外，艾雯雯還擁有超強的自學習、自適應能力，能夠
生物物理所等在管狀內質網功能研究方面取得進展
3月21日，eLife雜志在線發表了中國科學院生物物理研究所胡俊杰課題組的研究論文“Quantitative proteomics reveal proteins enriched in tubular endoplasmic reticulum of Saccharomyces cerevis
李雯：學業導師成為“網紅”
李雯 日前，一段名叫李老師，我們想讓全世界知道我們愛您！的視頻在江蘇大學朋友圈得到眾多轉載和點贊。這是江蘇大學管理學院信息1302班畢業生自拍的感恩視頻，為了感謝陪伴了四年的學業導師、江蘇大學管理學院信息系教師李雯。 成為網紅，是李雯萬萬沒有想到的事，聯系到她時，她反復強調自己只是一
上科大發ACS：親和質譜從草藥中篩選抑制食欲活性組分
? ?2020年2月26日，上海科技大學iHuman研究所、生命科學與技術學院的水雯箐課題組在ACS Central Science（2018影響因子：12.837）上發表文章，使用GPCR配體篩選親和質譜技術，從傳統草本植物中發現靶向藥物受體的新型激動劑，預期或與FDA批準上市減肥藥氯色卡林有類似
云南甘棠箐遺址出土30萬年前木器
近日，中國科學院古脊椎動物與古人類研究所聯合國內外多家科研單位，報道了云南省江川縣甘棠箐遺址發掘出土的35件保存完好的、年代約為距今30萬年的木器，以及與木器伴生的文化遺存如大量石制品、骨角器、動物化石和植物遺存。甘棠箐遺址出土的木器和鹿角“軟錘”是目前東亞地區最早的發現，在世界范圍內的舊石器時代遺
Proteome－and－Phosphoproteome－Quantification－by－DIA－on－Orbitrap－（二）
FIGURE 2. Comparison of DDA and DIA raw data. (A) Comparison of MS1 base peak chromatograms. (B) Comparison of zoomedin chromatograms. (C) Composi
Proteome－and－Phosphoproteome－Quantification－by－DIA－on－Orbitrap－（一）
Overview1) Purpose: Data Independent Acquisition (DIA) has been applied for large-scale protein and PTM quantification on the Thermo Scientific ?
蛋白質DIA檢測原理
數據非依賴性的掃描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式。可以對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂，采集所有母離子的碎片離子信息進行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白質組學研究手段，如iTRAQ\TMT、 Label-fr
傅雯娟：借鑒國際經驗推動節能環保
第一期中國中青年領導干部赴日本節能環保與經濟發展方式轉變專題培訓班開班式近日在京舉行，中央紀委駐環境保護部紀檢組組長傅雯娟出席會議并代表環境保護部部長周生賢對培訓班的開班表示熱烈祝賀。 傅雯娟指出，今年的中青年領導干部赴日培訓班由中組部、外交部、環境保護部和國家外專局共同舉辦，確定
銳雯－－漆膜鉛筆劃痕硬度儀產品操作
鉛筆硬度試驗機產品操作：1、試驗儀：要保證砝碼的重量1000+/-50g垂直作用于鉛筆芯與試驗臺交點上，使鉛筆與試驗臺保持45度夾角不變。試驗臺可移動，用鉛筆劃出劃痕。2、一組中華牌繪圖鉛筆6H-6B。鉛筆制備;削去木桿露出3mm鉛芯，在砂紙上畫圓圈，將鉛筆尖沒成平面使邊緣銳利。3、試驗必須在溫度2
2025蛋白質組學大會之非變性質譜分析與蛋白質結構
分會報告水雯箐 教授上海科技大學Conformational Dynamics of GPCR Signaling Complexes Revealed by Structural MS 上海科技大學水雯箐教授圍繞G蛋白偶聯受體（GPCR）復合物的結構動態性，展示其課題組發展、聯用多種結構質譜方法
王洪博士：膜蛋白質組學｜WeOmics－O28
“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研討會?由The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project，CN-HUPO，西湖大學Guomics實驗室，西湖實驗室iMarker實驗室共同舉辦，并由西湖
強強聯合（脂質組+DIA），IF>10（一）
脂質組學技術?相比其他組學技術，脂質組學技術發展較晚，新穎性高，僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。DIA技術 新一代、革命性的蛋白質組技術DIA,相比傳統的蛋白質組技術（shotgun，Label fr
強強聯合（脂質組+DIA），IF>10（二）
5.聚類分析為了進一步識別人群隊列中潛在的相似代謝，基于KODAMA值進行partition around medoids clustering分析，鑒定到4個cluster(A,B,C,D)。比較有意思的是，不同cluster的PEs的發生具有顯著差異，分別是Cluster A：71%，Clust
銳雯－－漆膜鉛筆劃痕硬度儀技術參數
鉛筆硬度試驗機技術參數：1、荷重500g或750g,1000g可選擇2、執行標準：GB/T6739-863、鉛筆與試樣夾角：45度4、劃痕速度：1mm/s
親和質譜技術：藥物靶標配體的高通量篩選
疾病相關的藥物靶標蛋白與小分子化合物的親和作用研究是當今開發新藥分子的熱點領域。親和質譜技術（Affinity Selection Mass Spectrometry）作為一種間接篩選小分子配體的方法，已經成功應用于許多受體、酶等靶蛋白的配體的篩選，并且得到了廣泛的應用。 親和質譜分析的基本原
廣西大學副教授黃雯：在海底“植樹造林”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511729.shtm 圖① 在廣西潿洲島珊瑚礁修復實驗區海域，黃雯做出下潛手勢。 圖② 在廣西潿洲島珊瑚館辦公室，黃雯在出海前檢查提前制作好的珊瑚苗托。◎劉 影 黃海珠 本報記者 劉 昊
數據非依賴采集DIA－解決方案（五）
九、相關產品Q Exactive 系列 Orbitrap 超高分辨質譜儀（Q Exactive、Q Exactive Plus 和 Q Exactive HF）?UltiMate ? 3000 RSLCnano 納升超高效液相色譜儀?Orbitrap Fusion“三合一”系列 Orbitrap 超
數據非依賴采集DIA－解決方案（三）
?圖 9. 三步完成 DIA 方法編輯?典型 DIA 數據如圖 10 所示，從色譜圖上看 DIA 數據與傳統 Shotgun 數據沒有明顯區別，只是每個循環的二級譜圖數量固定，因此掃描點分布均勻。?圖 10. 典型的 DIA 數據?圖 11. 四步完成 msxDIA 方法編輯?2. msxDIAOr
數據非依賴采集DIA－解決方案（二）
二、特點與優勢?數據非依賴采集（DIA）：? 采集所有離子及碎片譜圖，不丟失任何信息，重現性好；? 數據易于追溯，即使目前的水平無法發現某些蛋白/ 化合物，未來可以回溯；? 無需優化方法，對于易降解樣品可以即刻采集，獲得數據后再深入挖掘；? 基于碎片離子（即母子離子對）定量，選擇性好，與 SRM/M
常見的質譜掃描模式丨DDA－－DIA
Data Dependent Acquisition DDA 1 之前已經提到，DDA可以同時獲得被測代謝物的一級質譜和碎片信息，母離子的篩選主要依靠研究者預先設定的條件，如信噪比，同位素分布，離子強度，選擇top-n等等。該方法由于采用了較窄的m/z（通常為~1Da）窗口進行篩選目標離子減
數據非依賴采集DIA－解決方案（一）
一、數據非依賴采集（DIA）隨著生命科學的快速發展，蛋白質組學的關注焦點和研究趨勢已經逐漸從定性轉向定量。定量蛋白質組學是對細胞、組織乃至完整生物體的蛋白質表達量及差異進行分析，對于生物過程機理的探索和臨床診斷標志物的發現與驗證具有重要意義。基于靜電場軌道阱 Orbitrap 的數據非依賴采集（Da
數據非依賴采集DIA－解決方案（四）
Skyline 軟件Skyline 軟件是華盛頓大學 MacCoss 教授實驗室開發的目標蛋白質組學分析軟件（https://skyline.gs.washington.edu），是 DIA/SWATH 數據處理的權威工具，由于功能全面、性能強大而受到普遍認可，是目前使用最廣泛的 DIA/S
廈門大學呂曉雯教授研究組博士后招聘
（實驗室網站：https://med.xmu.edu.cn/2020/0915/c15900a413563/page.htm）研究方向為胚胎干細胞定向分化過程中的三維基因組學，通過優化并開發生物信息分析流程提出新的理論模型，采用最新的基因編輯技術并優化多組學文庫構建技術對模型進行生物學功能驗證。
傅雯娟強調－不斷提高組織協調工作水平
2012年全國環保系統紀檢組長座談會今日在甘肅省蘭州市召開。甘肅省紀委副書記、省預防腐敗局局長楊志宏到會致辭。環境保護部黨組成員、中央紀委駐環境保護部紀檢組組長傅雯娟在會上強調，全國環保系統各級紀檢監察部門要準確把握組織協調工作的要求和方法，不斷提高組織協調工作水平，深入推進環保系統黨風廉政建設
中國工程院院士王士雯、顧夏聲逝世
老年心臟病學和老年急救醫學專家，中國工程院院士王士雯，因病醫治無效，于2012年1月30日20時50分在北京不幸逝世，享年79歲。（訃告） 王士雯簡介（來源：中國工程院官網） 王士雯（1933.3.29? -）女 回族 老年心臟病學和老年急救醫學專家.山東省嶧縣人。1955年畢業