OxfordNanopore：納米孔測序儀開放試用
在上個月的美國人類遺傳學協會年會上，英國Oxford Nanopore Technologies公司宣布將啟動MinION測序儀的試用計劃。這次，它果然沒有食言。MinION試用計劃于11月25日啟動，將延續到2014年初，具體截止日期未定。 根據這項試用計劃，參與者須支付1,000美元的押金以及運費，而后將收到一臺MinION測序儀，包括測序USB裝置、流動槽和軟件。 除了MinION測序儀，Oxford Nanopore還在開發GridION測序儀。之前，該公司一直沒有公布這兩款測序儀的具體性能參數，但鑒于許多客戶有意了解，它最近在網站上回答了一些常見問題。 GridION和MinION系統的通量如何? 據介紹，GridION系統是可以擴展的。它既可以單獨作為一臺儀器工作，又可以多臺連接，帶來更快的結果。至于儀器的通量，它會受到各種因素的影響，包括 DNA的處理速度以及芯片上同時開展的......閱讀全文
MinION測序儀再次開放試用
英國Oxford Nanopore Technologies公司近日宣布，它重新開放了MinION測序儀的早期試用計劃，希望吸納更多用戶來參與。同時，越來越多的計劃參與者開始展示和發表他們的結果。 在上周舉行的AGBT 2015大會上，英國基因組分析中心和美國冷泉港實驗室的研究人員就介紹了利用
MinION測序儀有望在極端環境中檢查人類疾病
MinION測序儀登上太空,科學家們不是為了證明基因測序的飛速發展,而是想利用其來幫助人類在極端環境中診斷疾病。 對于該試驗,Rubins宇航員有自己的一些期望,她說,"目前,我們不能實時分析太空中發生在人類以及細胞中的事情。我們的空間站擁有一個具有15年歷史的干凈水源,但是這些水源是否存在微
生物學中的應用1：對MinION測序結果中base－calling的計算
記得去年“阿爾法狗”（AlphaGo）的新聞出來后，小編曾下定決心要跨專業學習一下AI，看看它能否在咱們生物領域也掀起熱浪。結果當小編剛剛了解到阿爾法狗的命脈乃來自Deep Learning （深度學習）真傳時，它的親兄弟“AlphaFold” 就以迅雷不及掩耳之勢（2018年12月初召開新聞發
Nature：掌上測序儀表現令人驚艷
今年四月份，伯明翰大學的Joshua Quick在行李中裝了三個測序儀（MinION）然后登上了去幾內亞的飛機。這在過去是難以想象的，因為絕大多數測序儀又大又重。在幾內亞，Quick只用12天就測序了14名埃博拉患者的病毒基因組，收集樣本之后48小時就能得到結果。 這對于流行病學家來說，是一個
Nature：實時、便攜式基因組測序
埃博拉病毒（EBOV）感染人類會引起致命的出血熱，發病率和病死率極高。2014年這種病毒在西非造成了嚴重的疫情，死亡人數已經超過11,000人。今年一月份，就在人們以為這場疫情正式結束之際，塞拉利昂又出現了新的病例。 本期Nature雜志發表的一項新研究展示了便攜式基因組測序儀在這次疫情中起到
全面解讀第四代測序技術
納米孔測序技術（又稱第四代測序技術）是最近幾年興起的新一代測序技術。目前測序長度可以達到150kb。這項技術開始于90年代，經歷了三個主要的技術革新：一、單分子DNA從納米孔通過；二、納米孔上的酶對于測序分子在單核苷酸精度的控制；三、單核苷酸的測序精度控制。目前市場上廣泛接受的納米孔測序平臺是Oxf
帶您了解第四代測序技術
納米孔測序技術（又稱第四代測序技術）是最近幾年興起的新一代測序技術。目前測序長度可以達到150kb。這項技術開始于90年代，經歷了三個主要的技術革新：一、單分子DNA從納米孔通過；二、納米孔上的酶對于測序分子在單核苷酸精度的控制；三、單核苷酸的測序精度控制。目前市場上廣泛接受的納米孔測序平臺是O
U盤大小的DNA測序儀證實可用于檢測病原體
由華大基因和生物醫學中心（BioMed Central）聯合創辦的大數據期刊《GigaScience》3月26日報道了掌上手持型DNA測序儀的最新成果，這種測序儀可以在短短6個小時時間里區分細菌和病毒的種類。 去年，由英國Oxford Nanopore公司開發的，僅4英寸長、普通U盤大小Min
Nature－Methods：放在背包里的測序儀
人們盼星星、盼月亮，總算等到了納米孔測序儀開放試用。如今，1000多個實驗室測試了MinION測序儀，并發表了結果。他們在這一期的《Nature Methods》上介紹了他們的使用體會。而更多的產品也在開發之中。 納米孔（nanopore）技術讓核酸分子穿過直徑只有幾納米的孔而確定其序列。這個
一臺筆記本電腦、一個USB！科學家在南極完成了測序
在過去的幾年中，研究界和商業界已經開始開發能用于野外現場研究的測序儀，牛津納米孔技術就是典型的例子之一。牛津納米孔公司的MinION測序儀是這幾年備受矚目的一款手持式納米孔測序商業設備，去年人家可是上過太空的，它也是唯一上過太空的測序儀。如今，科學家們又僅憑一臺MinION設備、一臺便攜式電腦就
測序簡史（四）
三、三代全長轉錄本分析工具三代全長轉錄本在輔助基因注釋，可變剪接分析，融合基因檢測方面可以說大顯身手，下面小編列了幾個工具及對應的下載地址，供大家參考。大家有好的最新的工具歡迎留言補充！1. 可變剪接鑒定（3個工具）1)網址：https://github.com/liuxiaoxian/IsoSeq
－Oxford－Nanopore：納米孔測序儀開放試用
在上個月的美國人類遺傳學協會年會上，英國Oxford Nanopore Technologies公司宣布將啟動MinION測序儀的試用計劃。這次，它果然沒有食言。MinION試用計劃于11月25日啟動，將延續到2014年初，具體截止日期未定。 根據這項試用計劃，參與者須支付1,000美
Nature－Methods：納米孔測序儀潛力無限
來自英國Oxford Nanopore公司的MinION是第一臺商業化的納米孔測序儀。它在帶來無限希望的同時，也承受著高錯誤率的質疑。英國伯明翰大學的Nicholas J. Loman和愛丁堡大學的Mick Watson在最新一期的《Nature Methods》上撰文，稱新開發的工具讓納米孔測
掌上測序儀新玩法：空氣微生物實時測
近日，英國基因組分析中心（TGAC）的研究團隊分享了利用MinION掌上測序儀，進行創造性研究。作為MinION首批試用者，TGAC摒棄以往需要把樣本帶回實驗室的做法，使用了微型測序設備對環境中成百上千種不同生物樣本進行現場物研究，以便研究人員能夠對實驗基因數據進行實時分析。 該研究的目標是測定空
納米孔測序儀首次于失重環境下完成測序實驗
科學家們在失重環境下進行實驗，首次證實掌上測序儀MinION可以在太空中使用。 Johns Hopkins大學的遺傳學家Andrew Feinberg和Lindsay Rizzardi登上了NASA的低重力飛機，在模擬的失重環境下完成了遺傳學實驗。“我非常享受這種體驗，感覺就像置身天堂，”Fe
Nature子刊首次展示掌上測序儀的巨大潛力
納米孔測序也被稱為第三代測序，而Oxford Nanopore公司則是這一領域的先行者。去年11月，該公司啟動了掌上測序儀MinION的早期試用計劃。這個備受關注的測序儀只有USB大小，可以實現即插即用。 East Anglia大學和Public Health England的研究團隊十二月九
詳解牛津納米孔測序儀
?牛津納米孔測序儀在美國人類遺傳學學會年會上公布技術參數 2014年的ASHG年會于10月18日開始在圣地亞哥舉行，有幸親眼目睹了牛津納米孔公司MinIon的現場演示，技術之創新，令人震驚!21日下午，牛津納米孔公司特地在旁邊的Hardrockho舉行了一個小型的封閉式的技術說明會，講解了納米孔的
Science及Nature共述：口袋里的DNA測序儀，可實時診斷
納米孔測序的想法起始于25年前， 2012年5月4日《Science》首次報道了Oxford Nanopore公司研制的納米孔測序儀樣機——MinION，用于破譯病毒DNA。然而MinION的發展歷程并不那么順利，英國牛津大學基因組學中心基因組學家Rory Bowden說，“眾所周知，在每次讀取
納米孔測序的過去、現在和將來
縱觀測序技術的發展歷程，沒有哪一個技術像納米孔測序那樣慢熱，但也沒有哪一個技術像納米孔測序這么接近普羅大眾。將單鏈DNA拉過蛋白孔，檢測堿基穿過時電導的微小改變，納米孔測序的這一基礎理念已經有十幾年歷史了。 1996年哈佛大學的DanielBranton、加州大學的DavidDeamer及其同
讓基因組測序繞過PCR擴增
在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-
多篇文章介紹掌上測序儀的新興應用
Oxford Nanopore的MinION掌上測序儀近來有點火。這邊廂，公司正忙著升級儀器，發布新產品；那邊廂，用戶也在不斷發表研究成果，從全長cDNA測序到快速的病原體測序。 上個月，康涅狄格大學健康中心的研究人員在BioRxiv預印本網站上發表了一項成果。他們利用MinION對四個果蠅基
多篇文章介紹掌上測序儀的新興應用
Oxford Nanopore的MinION掌上測序儀近來有點火。這邊廂，公司正忙著升級儀器，發布新產品；那邊廂，用戶也在不斷發表研究成果，從全長cDNA測序到快速的病原體測序。 上個月，康涅狄格大學健康中心的研究人員在BioRxiv預印本網站上發表了一項成果。他們利用MinION對四個果蠅基
手持基因測序儀問世－僅手機大小
康涅狄格州立大學的研究人員通過使用一種比手機還要小的手持測序儀，對自然界中已知的最復雜基因的RNA進行了測序。 當一個DNA鏈穿過納米孔測序儀MinION時，MinION可以“看見”五個核苷酸。五個核苷酸一組會生成一個特征電流，使MinION可以連續讀出DNA編碼。 如果說DNA是生命模板
納米孔測序搞定超級難搞的基因
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一臺MinION測序儀的。他所在的康涅狄格大學實驗室是首批獲得Oxford Nanopore Technologies測序儀的客戶。盡管準確性不穩定，通量也不高，但Graveley和他的同事決定立刻就試試。 對于MinION，眾多討論
納米孔測序搞定超級難搞的基因
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一臺MinION測序儀的。他所在的康涅狄格大學實驗室是首批獲得Oxford Nanopore Technologies測序儀的客戶。盡管準確性不穩定，通量也不高，但Graveley和他的同事決定立刻就試試。 對于MinION，眾多討論
哪些因素影響納米孔測序儀的重復性？
掌上測序儀好不好？用過才知道。最近，五個試用了Oxford Nanopore MinION測序儀的實驗室評估了儀器的重復性，并在開發標準操作和參考數據。這些實驗室屬于MinION分析和參考聯盟（MARC），該聯盟由MinION早期試用計劃的參與者組成。目前，第一階段的結果已經發表在開放獲取期刊
盤點：2015年那些橫空出世的“非典型”測序儀
提及測序儀，那就不得不說Illumina和Thermo兩只“大鱷”。這兩家公司提供的測序儀占據了絕大部分市場份額。出于應對特殊政策的需要，國內的幾家企業也紛紛推出了“自己”的測序儀。放眼國際市場，有一些企業另辟蹊徑，研發出別具特色的測序儀，力圖從壟斷者手中分得一杯羹。小編今天就帶大家認識一下這些
詳解牛津納米孔測序儀
2014年的ASHG年會于10月18日開始在圣地亞哥舉行，有幸親眼目睹了牛津納米孔公司MinIon的現場演示，技術之創新，令人震驚!21日下午，牛津納米孔公司特地在旁邊的Hardrockho舉行了一個小型的封閉式的技術說明會，講解了納米孔的測試結果。 尺寸 MinION的尺寸之小，大大出乎我的
1.39億美元！全球測序巨頭Oxford－Nanopore獲知名機構投資
牛津納米孔總部位于英國，公司研發、生產和銷售世界上唯一的便攜式、實時DNA/RNA測序儀。此次募得資金主要用于公司下一階段的業務擴張，其中，包括在牛津建設一個全新的、高產能的生產基地，以滿足市場對牛津納米孔測序儀產品日益增長的需求；以及擴大服務位于全球70多個國家客戶的市場和銷售團隊。 同時，