高通量蛋白質檢測技術獲重大突破
后基因組時代蛋白質組閃亮登場中國計量院高通量蛋白質檢測技術研究取得重大突破 “高通量蛋白質分離檢測關鍵技術研究取得的突破給我們很大鼓舞，但這只是我們大規模系統集成研究的一部分，我們正在著力于系統后續的研究。相信，在不久的將來，這套集成系統將為蛋白質組的分析提供一個完整規范的平臺。”談起不久前通過項目鑒定的《高通量蛋白質分離檢測關鍵技術研究》和取得的成果，中國計量科學研究院生物、能源與環境研究所科學儀器研究室主任劉新志顯得躊躇滿志。 隨著全球性的國際人類基因組計劃的初步完成，一個以蛋白質和基因調節為研究重點的后基因組時代已經拉開序幕。蛋白質是生理功能的執行者，是生命現象的直接體現者，對蛋白質結構和功能的研究將直接闡明生命在生理或病理條件下的變化機制。伴隨人類基因組研究而發展的蛋白質組學則是研究細胞內各種蛋白質的組成及其活動規律的一門新興學科。后基因組時代，蛋白質組將成為重點研究方向之一，并將有力推動生物產業的持續性高速發展。 ......閱讀全文
關于基因組高通量測序的技術發展介紹
高通量測序平臺(high-throughput_genome_sequence_database) 自從2005年454 Life Sciences公司（2007年該公司被Roche正式收購）推出了454 FLX焦磷酸測序平臺（454 FLX pyrosequencing platform）以
基因組高通量測序的原理
測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等，1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序，每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和標準M
將基因組存進銀行－迎接真正的基因組時代
你知道在你身上什么東西比錢更有價值，并且還是唯一的嗎？答案是：你的基因組。就像你的錢一樣，你的基因組也應該被盡可能安全的存儲起來。而那些負責存儲你基因組的機構應該對如何存儲、使用以及分享它進行監管。 隨著醫學科學的進步，人們能夠控制和管理他們的個人基因組將變得越來越重要。為
全球進入后基因組新時代
最新一期的Nature News發表了一篇基因組學方面的新聞，該文章稱，不論體型，外表，不論是將滅絕或是已滅絕，新的基因組計劃即將對全球的各種動物進行測序。全球進入基因組新的時代。 關注基因組學的讀者都知道，現存的多種動物，植物，人類的基因組都已經被科學家破解，甚至那些已經滅絕的動物的基因
關于基因組高通量測序的基本介紹
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(
茄子基因組研究邁入高清時代
10月31日，由廣西農業科學院蔬菜研究所研究員王益奎領銜的研究團隊，于生物學論文預印本服務器BioRxiv在線發布了染色體級別的高質量茄子基因組序列。該團隊采用PacBio測序技術，結合Dovetail Hi-C建庫技術與HiRise組裝算法，獲得了目前連續性最好的茄科作物基因組，標志著茄子基因
茄子基因組研究邁入高清時代
10月31日，由廣西農業科學院蔬菜研究所研究員王益奎領銜的研究團隊，于生物學論文預印本服務器BioRxiv在線發布了染色體級別的高質量茄子基因組序列。該團隊采用PacBio測序技術，結合Dovetail Hi-C建庫技術與HiRise組裝算法，獲得了目前連續性最好的茄科作物基因組，標志著茄子基
HiSeqXTen開創基因組測序的新時代
新年伊始，Illumina公司在第32屆摩根大通保健大會上重磅推出最強大的測序儀：HiSeq X Ten。這一套測序系統包括10臺HiSeq X測序儀，適合群體規模的測序項目。據Illumina介紹，HiSeq X Ten首次讓$1000的基因組測序成為現實。以Illumina成熟的
北京基因組所開發新型高通量單細胞多組學新技術
單細胞測序已成為生物醫學領域的關鍵共性技術。然而，由于缺乏高效的手段降低“假單細胞率”，主流微流控平臺的單通道細胞通量通常在1萬細胞以下，空載率達到90%以上，且成本高昂，限制了對數百萬個細胞或上千例樣本的人群隊列進行大規模研究。 近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）蔣嵐研究組
基因組技術來了，“人人基因”時代中國產業如何爭上游？
何菊虹(化名)41歲時懷上了二胎，在西安一家民營醫院產檢“唐氏篩查”時，被醫生告知“一切正常”，但孩子出生后被確診為唐氏綜合征患者，一家人的生活從此陷入為孩子康復、治療的絕望里。 “如果當時就有無創產前基因檢測，這樣的悲劇就基本不會發生了。”深圳華大基因執行副總裁朱巖梅在朋友圈如此評論。 何
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨挑戰 2003年4月人類基因組圖譜基本繪制完成，但對基因的調節與功能問題仍未能解讀。由于基因的功能主要是通過其編碼的蛋白質來實現，蛋白質才是生命活動真正的執行者，所以越來越多的科學家致力于蛋白質的研究，試圖找出人類疾病的致病機理，最終解決人類
生物信息學技術分離蛋白質組的介紹
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
動物基因組DNA－的分離純化實驗
鹽溶法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 根據核糖核蛋白與脫氧核糖核蛋白在一定濃度的氯化鈉溶液中的溶解度不同進行分離, 然后用蛋白質變性沉淀劑去除蛋白,使核酸釋放出來, 再利用
動物基因組DNA－的分離純化實驗
實驗方法原理 根據核糖核蛋白與脫氧核糖核蛋白在一定濃度的氯化鈉溶液中的溶解度不同進行分離, 然后用蛋白質變性沉淀劑去除蛋白,使核酸釋放出來, 再利用核酸不溶于乙醇的性質將核酸析出, 達到分離提純的目的。在0 . 14 mol/ L 的氯化鈉溶液中, RNA 核蛋白(RNP) 溶解度大, 而DNA
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質（isforms)等現象在基因水平無從表現
高通量蛋白質檢測技術獲重大突破
后基因組時代蛋白質組閃亮登場中國計量院高通量蛋白質檢測技術研究取得重大突破 “高通量蛋白質分離檢測關鍵技術研究取得的突破給我們很大鼓舞，但這只是我們大規模系統集成研究的一部分，我們正在著力于系統后續的研究。相信，在不久的將來，這套集成系統將為蛋白質組的分析提供一個完整規范的平臺。”談起不久前通過項
推進后基因組時代物理生物學探索
5月7日~8日，科學與技術前沿論壇在中科院學術會堂召開，此次論壇的主題為“后基因組時代的物理生物學”。歐陽鐘燦、郝柏林、陳潤生、歐陽頎等多名來自全國各大高校和科研院所的院士和學者出席了此次論壇，并發表了主題演講。 本次論壇召集人中科院院士楊玉良表示，上世紀末以來，生命科學獲得了飛速發展，積累了
通過全基因組測序進入輸血的新時代
一項發表在Lancet子刊《The Lancet Haematology》，依托于全球首個健康成年人全基因組隨機試驗“MedSeq 項目（MedSeq Project）”的研究開發并驗證了一款電腦程序，將全面和經濟地測定血型個體差異，準確率為99%以上。A、B、O和AB型是我們比較了解的血型，實際上
破譯“生命天書”20年：基因組時代曙光初現
2001年2月15日，被稱為破譯“生命天書”的人類基因組序列草圖正式發表。20年前，我國科學家參與并完成國際“人類基因組計劃”（HGP）1％的任務，使我國成為世界上少數幾個能獨立完成大型基因組分析的國家，為中國生命科學研究和生物產業發展開拓了無限的空間。 20年來，這一劃時代的成就，給人類對疾
Nature：CRISPRCAS9推動后基因組時代
近日，來自美國的科學家在國際期刊Nature發表了他們的最新研究成果，他們利用結構導向的方法改造了CRISPR-CAS9復合物來系統性研究基因功能，并通過構建sgRNA文庫大規模篩選抵抗BRAF抑制劑的激活基因。該文章利用CRISPR-CAS9技術研究基因功能，對后基因組時代的基因功能研究具有推
Aebersold研究組發布用于全蛋白質組的高通量定量方法
瑞士蘇黎世聯邦理工學院的研究人員領導的一個研究小組，已制定了一個質譜工作流，用于對整個蛋白質組進行高通量的絕對定量。 據ETH的研究者、該研究的領頭人Ruedi Aebersold說，對于多種形態，該技術實現了目標蛋白質組的重現性定量，提供用于
蛋白質組學分離分析方法進展
分析測試百科網訊 2015年10月17日，第二屆全國質譜分析學術報告會（質譜大會）在浙江大學紫荊港校區體育館盛大開幕。中國科學院大連化學物理研究所 張玉奎 來自中國科學院大連化學物理研究所的張玉奎院士帶來了題為《蛋白質組學分離分析方法進展》的報告。 張玉奎主要介紹了蛋白質樣品預處理、蛋白質組
蛋白質組學之逆襲，深度注釋基因組
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（四）
2.3 ?高通量的分子標記檢測?本方法制備的DNA濃度雖然低，用96針復制器加入0.5~1 μL模板進行33~35個PCR循環就可獲得足夠濃度的產物，并不需要加入特別多的Taq酶(甚至使用量為每45~50 μL PCR反應液1 U也能擴增分子標記)。該方法已對數萬份水稻樣品進行了分子標記(S
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（一）
摘? 要：制備大量生物樣品的模板DNA用于PCR檢測是費時費人工的工作。本文介紹一種高通量的植物基因組DNA(gDNA)快速制備及其用于PCR基因型檢測的操作方法。將一小段單子葉植物苗葉片(長度約30 mm或40 mm，與96方孔板的孔深大致相同) 或一小塊(約2~4 mg)雙子葉植物葉片放入9
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（三）
將純化定量的水稻品種(93-11)基因組DNA標準樣品(0.5~8 ng)與1.0 μL本方法制備的水稻品種(02428)基因組DNA混合作為模板，用InDel 標記引物(表1)進行PCR擴增和PAGE檢測。箭頭指某反應(或2個反應之間)其02428與93-11條帶的信號值大致相等(即DNA
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（二）
1.2? 植物材料 ?1.2.1 水稻秧苗。將1.6-mL 96方孔板底部用6 mm電鉆頭打穿，或將舊96孔PCR板的底部剪去約4 mm。使用時將方孔板壓入少量泥巴。每孔放入1粒萌動的水稻種子，在自然日光下(或人工氣候箱)生長至3~4片葉。其他植物小苗也可用類似方法種植。?1.2.2 水稻大植株的鮮
關于基因組高通量測序的基本原理介紹
測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等，1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序，每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和標
植物基因組總DNA的分離———SDS法
實驗方法原理SDS(十二烷基磺酸鈉)是一種強去污劑,可使細胞膜及核膜破裂,因此被用來分離DNA。該分離過程的第一步是用熱的去污劑(SDS)進行抽提,然后將抽提物置于0℃并加入高摩爾濃度的乙酸鉀,離心去除不溶物,以去除蛋白和多糖類雜質。實驗材料植物新鮮葉片試劑、試劑盒液氮提取緩沖液(用前加入)20%S