重要作物染色質三維構象新特征成功解析
山東農業大學李平華課題組和香港中文大學鐘思林課題組的合作研究團隊，日前在重要作物大基因組染色質研究領域獲得重大突破。近日，國際學術期刊《分子植物》發表了該項研究成果論文。 該團隊利用最新的高通量染色體構象捕獲技術，通過對玉米、番茄、高粱、水稻和小米等主要作物的染色質空間結構進行研究，成功揭示了染色質三維結構與其表觀遺傳學修飾的關系。據介紹，染色質是真核生物遺傳物質的主要載體，控制生物形態、生理和生化等特征的結構基因就排列在染色質上，其空間結構對基因表達調控、DNA復制和重組具有重要影響。“隨著染色質構象捕獲技術的發展，人們對染色質空間結構和生物功能有了深刻認識，但對于植物基因組空間結構的認識主要來自對模式植物擬南芥的研究。”李平華說。 “研究發現，在基因組水平上，類似人類染色質、植物染色質也可以按照染色質交互狀態活躍與否分為活化/失活兩種類型區隔。”據李平華介紹，課題組在更高的分辨率下對植物染色體結構做了進一步解析，發現......閱讀全文
重要作物染色質三維構象新特征成功解析
山東農業大學李平華課題組和香港中文大學鐘思林課題組的合作研究團隊，日前在重要作物大基因組染色質研究領域獲得重大突破。近日，國際學術期刊《分子植物》發表了該項研究成果論文。 該團隊利用最新的高通量染色體構象捕獲技術，通過對玉米、番茄、高粱、水稻和小米等主要作物的染色質空間結構進行研究，成功揭示了
新技術分析單細胞的染色質構象
分析染色質構象的技術不少，但有的需要大量細胞，有的則分辨率太低。這阻礙了我們對于單細胞中染色質構象的了解。近日，瑞典卡羅林斯卡學院的研究人員在《Biotechniques》上介紹了一種新方法，能夠高分辨率地分析單細胞中染色質的接近程度。 對于理解基因調控、DNA復制和修復來說，研究染色體的
研究觀測到染色質重塑中DNA的BZ構象轉變
近年來，Z型DNA（Z-DNA）的研究引發關注，但是在細胞中對其進行觀測還存在困難，主要原因是缺少一種簡便可靠的手段對其進行直接觀測。最近，中國科學院合肥物質科學研究院智能機械研究所研究員黃青課題組與鄭州大學張鳳秋課題組合作，利用紅外光譜技術觀測并研究染色質重塑中DNA的B-Z構象轉變，相關研究
冷凍電鏡三維結構的多構象性和動態分析
?三維結構的多構象性和動態分析生物大分子通常具有內稟的柔性，所以生物分子的動態結構變化以及結構的不均一性一直是結構生物學的研究重點之一。在晶體狀態下，生物分子的結構變化被晶格約束，一般只提供一個靜態的結構和有限的動力學參數。冷凍電鏡相比晶體學方法的優勢在于可以捕捉生物分子在溶液中的形態，并記錄下不同
秈粳稻耐高溫差異染色質三維結構機制被揭示
近日，中國農業科學院生物技術研究所谷曉峰團隊和合作者在BMC Biology上發表論文。該項研究首次揭示了秈稻和粳稻染色質三維空間結構在高溫脅迫下發生重組的動態變化，為深入研究水稻響應環境脅迫信號的表觀遺傳精準調控機制和設計改良提供了新途徑。 真核生物染色質三維空間結構在基因轉錄調控和控制多
細胞衰老過程中染色質三維結構的變化
細胞衰老是細胞非常重要的生命過程，與疾病發生、個體衰老有著密切的關系。通常認為細胞衰老可以由內在或外在的壓力引起，與細胞內持續的DNA損傷密切相關。大量的已有研究表明，無論是個體衰老還是細胞衰老都與細胞中異染色質狀態的改變有著密切的關系，其中，衰老過程中一個重要的現象是異染色質的丟失。同時，保持
構象異構體的分子鏈構象
晶體中的高分子鏈構象晶體中的分子鏈構象有螺旋形構象、平面鋸齒形構象等。1、兩個原子或基團之間距離小于范德華半徑之和時，將產生排斥作用。2、分子鏈在晶體中的構象，取決于分子鏈上所帶基團的相互排斥或吸引作用的情況。3、有規立構高分子鏈在形成晶體時，在條件許可下總是盡量形成時能最低的構象形式。4、基本結構
雜交豬單倍型分辨率三維基因組特征成功解析
我國是世界第一養豬大國，2023年出欄生豬7.27億頭，占全球總量54.89%。生豬在國計民生、糧食安全和社會穩定中具有重要地位和作用。篩選并鑒定影響豬重要經濟性狀的關鍵基因組變異，挖掘育種靶點，創新性運用到實際育種中，能有效加速優質高產豬新品種（系）的培育進程。因此，系統鑒定豬基因組中的調控元件并
哺乳動物細胞熱刺激反應中染色質空間構象改變的新解釋
熱刺激是細胞經常面對的環境刺激，熱刺激反應是所有細胞普遍具有的刺激反應機制。熱刺激誘導的廣泛的轉錄調控是熱刺激反應的重要組成部分。近年來，科學家從表觀遺傳學的各層面對其機制開展了研究。當前，針對染色質空間構象這一重要的表觀遺傳學層次，是否在熱刺激反應中發揮作用以及可能的具體作用形式存在爭議。此外
北京基因組所解釋了細胞在熱刺激反應中染色質構象改變
熱刺激是細胞經常面對的環境刺激，熱刺激反應是所有細胞普遍具有的刺激反應機制。熱刺激誘導的廣泛的轉錄調控是熱刺激反應的重要組成部分。近年來，科學家從表觀遺傳學的各層面對其機制開展了研究。當前，針對染色質空間構象這一重要的表觀遺傳學層次，是否在熱刺激反應中發揮作用以及可能的具體作用形式存在爭議。此外
擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構及基因表達調控
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
LSC功能和特性的染色質三維調控景觀獲揭示
角膜緣干細胞（limbal stem cell，LSC）位于角膜與結膜交界處的角膜緣區域，在角膜上皮穩態維持、角膜透明性和完整性中發揮關鍵作用。近日，中山大學中山眼科中心歐陽宏團隊研究發現影響LSC功能和特性的染色質三維調控景觀。相關研究發表于《自然-通訊》。李名森副研究員為該論文第一作者，歐陽宏教
中國醫學科學院最新文章解析HOX基因表達模式
“核心刊物”迎來了新期刊：科學通報，中國科學C輯:生命科學，這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的，我國學術期刊中的知名品牌，被國內外各主要檢索系統收錄，如國內的《中國科學論文與引文數據庫》（CSTPCD）、《中國科學引文數據庫》（CSCD）等；美國的SCI、CA、EI，英
中國科大在染色質重塑SWI/SNF與INO80復合體結構研究獲進展
中國科學技術大學教授蔡剛課題組利用冷凍電鏡技術，解析了染色質重塑SWI/SNF與INO80復合體及其不同核小體結合狀態復合物的三維結構，揭示了SWI/SNF與INO80復合體共有的肌動蛋白(Actin)和核肌動蛋白相關蛋白(Arps)組成的Actin/Arp模塊作為構象調控的分子開關，調控核小體結合
構象的概念
構象（conformation），有機化學的一個重要概念。最簡單的構象分析建立在乙烷分子上。最重要的構象分析則是建立在環己烷上的構象分析。
什么是構象？
構象（conformation），有機化學的一個重要概念。最簡單的構象分析建立在乙烷分子上。最重要的構象分析則是建立在環己烷上的構象分析。
Genome－Biology：構建豬體細胞染色質三維結構圖譜
豬不僅是重要的經濟家畜，在生物醫學領域也有重要應用。生豬的育種中廣泛應用了輔助生殖技術，包括體外受精技術、孤雌和孤雄生殖技術等。但與體外受精胚胎相比，孤雌和孤雄胚胎的存活率級低。這一存活率差異產生的機制目前還不清楚。深入理解這一機制不僅有助于增加商業化豬育種的產仔數，也將有利于生物醫學研究中轉基
揭示基因“無用”序列穩定染色質三維結構及細胞穩態機制
人類基因組中的非編碼序列在多種生物學過程中發揮著至關重要的作用，如非編碼RNA、啟動子、增強子和轉座子等。作為在基因組中占比約98%的非編碼區域，仍有大量是功能未知的，這些曾被認為是基因組中“垃圾”的區域，已被逐漸證實存在重要功能。基因組的三維結構會影響基因的轉錄調控或其他細胞生命活動，然而，除
研究揭示擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
染色質重塑SWI/SNF與INO80復合體新發現
中國科學技術大學蔡剛教授課題組利用冷凍電鏡技術，解析了染色質重塑SWI/SNF與INO80復合體及其不同核小體結合狀態復合物的三維結構，揭示了SWI/SNF與INO80復合體共有的肌動蛋白(Actin)和核肌動蛋白相關蛋白(Arps)組成的Actin/Arp模塊作為構象調控的分子開關，調控核小體
MolecularCell：精子發生過程中染色質高級結構“重編程”模式
在真核生物中，線性DNA通過多層級地折疊以特定的三維結構存在于細胞核中。染色質三維結構對于基因調控、DNA復制和細胞分裂等過程具有重要作用，其異常會導致基因表達失調和發育畸形。哺乳動物中，新的生命由精子和卵子的產生、結合以及隨后的早期胚胎發育開啟。在形成配子以及全能性胚胎的過程中，染色質需要經歷
揭示麂屬動物染色體融合的分子機制及基因組三維構象
麂屬動物是鯨偶蹄目、反芻亞目、鹿科、麂亞科下的一類哺乳動物，屬內各物種間差異巨大的染色體數目而受到生物學家關注，是研究哺乳動物成種機制和染色體演化的優異模型。小麂、黑麂是我國特有的物種，黑麂和貢山麂是我國重點保護野生動物。黑麂和貢山麂都有8條（雌性）和9條（雄性）染色體，它們的核型卻不相同，而小
科學家揭示衰老對免疫細胞三維染色質組織的影響
6月12日，美國國立衛生研究院衰老研究所研究員Ranjan Sen課題組，首次揭示了衰老對免疫細胞中三維染色質組織的影響，并將其與B細胞的發育和其前體細胞的功能聯系在了一起，展示了基因組學和三維染色質研究在揭示衰老機制方面的巨大潛力，提供了一種未來開發抗衰老療法的可能方向。相關研究發表于《自然—細胞
合肥研究院揭示G0調控染色質空間構象cox2基因的作用機制
近期，中國科學院合肥物質科學研究院技術生物與農業工程研究所吳李君課題組運用染色質構象捕獲技術，探究并闡明了氧化石墨烯（GO）對染色質空間構象的影響及具體的作用機制。氧化石墨烯對染色質構象調控的作用機制示意圖 氧化石墨烯作為碳族納米材料的典型代表，在材料、能源、電子、生物醫藥等領域有著廣泛的應用
科學家首次揭示油菜雜交種的染色質三維結構特征
?染色質三維結構變化影響油菜雜種優勢模式圖? ? ? ? ? ? ?課題組供圖雜種優勢是生物界普遍存在的遺傳現象，指雜合體在一種或多種性狀（如生活力、生長勢、繁殖力、抗逆性、產量、品質等）上優于雙親的現象。雜種優勢育種在農業生產中的成功應用為提高農作物產量、解決糧食危機、保障糧食安全等方面做出了巨大
Nature－Methods－：北大湯富酬團隊揭示單個細胞內高階染色質結構
調控基因組元件的高階三維(3D)組織為基因調控提供了拓撲基礎，但尚不清楚哺乳動物基因組中的多個調控元件如何在單個細胞內相互作用。 2023年8月28日，北京大學湯富酬團隊在Nature Methods （IF=48）在線發表題為“scNanoHi-C: a single-cell long-r
細胞化學詞匯RNA構象
中文名稱：RNA構象英文名稱：RNA conformation定 義：RNA分子的空間結構，構象改變并不導致共價鍵的斷裂和生成。應用學科：生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
順向構象的定義
中文名稱順向構象英文名稱cisoid conformation定 義有機分子中單鍵為順式的構象。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），總論（二級學科）
椅型構象的概念
在環已烷中，六個碳原子不在同一個平面內,碳碳鍵之間的夾角為109.5°，沒有環張力，因此環很穩定。環已烷由于環的翻轉可以形成多種構象，其中，椅型和船型這兩種典型的構象最為重要。船型構象能量高，不能穩定存在，而椅型構象能穩定存在。
β－轉角的特定構象特點
β－轉角的特定構象在一定程度上取決與他的組成氨基酸，某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸經常存在其中，由于甘氨酸缺少側鏈(只有一個H)，在β－轉角中能很好的調整其他殘基的空間阻礙，因此是立體化學上最合適的氨基酸；而脯氨酸具有環狀結構和固定的角，因此在一定程度上迫使β－轉角形成，促使多肽自身回折且這些回折有助于