擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構及基因表達調控
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chromatin organization and transcriptional regulation 的研究論文。該論文利用染色質構象捕獲等技術解析了擬南芥基因組加倍所導致的基因三維空間變化及對基因轉錄調控的影響。 植物多倍化是自然界中非常普遍的現象，是推進植物進化、適應環境的主要方式之一。多倍體的形成增加了基因表達調控的復雜程度，目前很多研究證明基因組的三維結構對基因組的轉錄調控起到很重要的作用。為了解析多倍化過程中三維基因組結構變化及多倍體基因組表達調控的影響，方玉達研究組利用染色體構象捕獲技術（Hi-C）繪制了擬南芥同源四倍體的......閱讀全文
研究揭示擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構及基因表達調控
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
擬南芥基因組DNA的提取
實驗概要本實驗介紹了用CTAB法提取擬南芥基因組DNA。主要試劑CTAB提取液(2%CTAB，50mMEDTA，50mM Tris-HCl，PH 8.0，0.84M NaCI，0.05%巰基乙醇)，氯仿，無水酒精，70%的酒精主要設備1.5 mL離心管，65℃水浴鍋，高速離心機，研缽實驗材料擬南芥葉
染色質的結構要點
1、每個核小體單位包括 200 bp左右的DNA超螺旋和一個組蛋白八聚體以及一個分子的組蛋白H1。2、組蛋白八聚體構成核小體的盤狀核心顆粒，相對分子質量100 000，由4個異二聚體組成，包括兩個H2A-H2B和兩個H3-H4。3、146 bp的DNA分子超螺旋盤旋組蛋白八聚體1.75圈。組蛋白H1
染色質DNA基因組的介紹
凡是具有細胞形態的生物其遺傳物質都是DNA,只有少數病毒的遺傳物質是RNA。在真核細胞中,每條未復制的染色體包含一條縱向貫穿的DNA分子。狹義而言,某一生物的細胞中儲存于單倍染色體組中的總遺傳信息,組成該生物的基因組。真核生物基因組DNA的含量比原核生物高得多。 突變分析結果表明,并非所有基因
異染色質和常染色質的結構差異
染色質可以分為兩種類群，異染色質和常染色質。最開始，這兩種形式是通過其在染色之后的顏色深淺區分的，常染色質一般著色較淺，而異染色質著色很深，表明其緊密聚集。異染色質通常集中在細胞核的邊緣區域。然而，不同于這種早期的二分法，最近的研究表明在動物和植物體內都擁有不止這兩種染色體結構，可能會有四到五種，區
重要作物染色質三維構象新特征成功解析
山東農業大學李平華課題組和香港中文大學鐘思林課題組的合作研究團隊，日前在重要作物大基因組染色質研究領域獲得重大突破。近日，國際學術期刊《分子植物》發表了該項研究成果論文。 該團隊利用最新的高通量染色體構象捕獲技術，通過對玉米、番茄、高粱、水稻和小米等主要作物的染色質空間結構進行研究，成功揭示了
Nature－Plants文章：精準高通量檢測Rloop分布的新方法
來自清華大學生科院，清華-北大生命科學聯合中心的研究人員發表了題為“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章，首次報道了精準、高效、高通量檢測R-loop的方法，并利用此方法首次揭示模式植物擬南芥
常染色質的結構特點
常染色質的結構類似于未折疊的一串珠子中間被一根細繩穿過，這其中的珠子代表核小體結構。每個核小體由八個蛋白質單體組成，這些蛋白質叫做組蛋白，每個組蛋白單體周圍有147個堿基對長度的雙鏈DNA環繞；在常染色質中，DNA在組蛋白上的包裹是較為松散的，從而其上的原始DNA序列是暴露在外可被讀取的。每一個處于
常染色質的結構簡介
常染色質的結構類似于未折疊的一串珠子中間被一根細繩穿過，這其中的珠子代表核小體結構。每個核小體由八個蛋白質單體組成，這些蛋白質叫做組蛋白，每個組蛋白單體周圍有147個堿基對長度的雙鏈DNA環繞；在常染色質中，DNA在組蛋白上的包裹是較為松散的，從而其上的原始DNA序列是暴露在外可被讀取的。每一個
常染色質的結構介紹
常染色質的結構類似于未折疊的一串珠子中間被一根細繩穿過，這其中的珠子代表核小體結構。每個核小體由八個蛋白質單體組成，這些蛋白質叫做組蛋白，每個組蛋白單體周圍有147個堿基對長度的雙鏈DNA環繞；在常染色質中，DNA在組蛋白上的包裹是較為松散的，從而其上的原始DNA序列是暴露在外可被讀取的。每一個處于
三維染色質結構與基因組功能及進化的關系獲揭示
辣椒是世界上種植最廣泛的蔬菜之一，也是重要的調味料作物。近日，華南農業大學園藝學院辣椒課題組研究揭示了辣椒三維染色質結構與基因組功能及進化的關系。相關研究發表于Nature Communications。 我國辣椒生產和消費量居全球之首，種植面積超過3000萬畝，產量4000多萬噸，年逾700
研究發現去甲基化酶REF6是基因組中靶向的重要因素
核小體是真核生物染色質的基本單位，由DNA纏繞組蛋白八聚體構成。組蛋白翻譯后共價修飾是表觀遺傳調控的重要方式之一，通過影響染色質的狀態而調控基因表達等過程。組蛋白H3第27位賴氨酸的三甲基化修飾(H3K27me3)通過維持基因的沉默狀態，在動植物細胞命運決定以及生長發育中發揮重要的調控作用。基因
Polycomb組蛋白與染色質相互作用的關鍵機制
2021年6月，Genome Research雜志在線發表了法國巴黎薩克雷大學植物科學研究所Moussa Benhamed教授為通訊作者題為“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
染色質修飾如何調控基因表達？－中國學者提出新見解
中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心的研究人員最新發表兩篇Nature Genetics文章，利用生化、分子、遺傳、組學及結構生物學等研究方法，分別揭示了植物特有染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的SHL和EBS形成BAH-EMF1復合體而介導植物基因沉默
生命科學：染色質修飾沉默植物基因表達領域獲重要突破
在國家自然科學基金(項目編號：31721001)等資助下，中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心何躍輝課題組在染色質修飾沉默植物基因表達領域獲重要突破，發現了植物特有的染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的蛋白形成BAH-EMF1蛋白復合體，以介導高等植物基因沉默的分子機制。研究成
染色質的基本結構單位介紹
20世紀70年代以前，人們關于染色質結構的傳統看法認為，染色質是組蛋白包裹在DNA外面形成的纖維狀結構。直到1974年Kornberg等人根據染色質的酶切和電鏡觀察，發現核小體是染色質組裝的基本結構單位，提出染色質結構的“串珠”模型，從而更新了人們關于染色質結構的傳統觀念
染色質的結構組成及功能
染色質是指間期細胞核內由DNA、組蛋白、非組蛋白及少量RNA 組成的線性復合結構，是間期細胞遺傳物質存在的形式。染色體是指細胞在有絲分裂或減數分裂過程中，由染色質聚縮而成的棒狀結構。實際上，兩者化學組成沒差異，而包裝程度即構型不同，是遺傳物質在細胞周期不同階段的不同表現形式。在真核細胞的細胞周期中，
關于染色質的結構要點介紹
1、每個核小體單位包括 200 bp左右的DNA超螺旋和一個組蛋白八聚體以及一個分子的組蛋白H1。 2、組蛋白八聚體構成核小體的盤狀核心顆粒,相對分子質量100 000,由4個異二聚體組成,包括兩個H2A-H2B和兩個H3-H4。 3、146 bp的DNA分子超螺旋盤旋組蛋白八聚體1.75圈
常染色質的結構和特點
常染色質是染色質（由DNA、RNA和蛋白質組成）的一種松散聚集的形式，這種聚集方式在基因中大量存在，并且相應的片段通常處于活躍的轉錄當中（但并非必要，即常染色質部分不一定都是高表達的序列）。常染色質構成了細胞核基因組中表達最活躍的一部分。人類基因組中92%為常染色質。
染色質的結構成分介紹
通過分離胸腺、肝或其他組織細胞的核，用去垢劑處理后再離心收集染色質進行生化分析，確定染色質的主要成分是DNA和組蛋白，還有非組蛋白及少量RNA。大鼠肝細胞染色質常被當作染色質成分分析模型，其中組蛋白與DNA含量之比近于1:1，非組蛋白與DNA之比是0.6:1，RNA與DNA之比為0.1:1。DNA與
簡述結構異染色質的特征
在間期核中,結構異染色質聚集形成多個染色中心(chromocenter)。在哺乳類細胞中,這些染色中心隨細胞類型和發育階段不同而變化。結構異染色質有如下特征: ①在中期染色體上多定位于著絲粒區、端粒、次縊痕及染色體臂的某些節段。 ②由相對簡單、高度重復的DNA序列構成,如衛星DNA。 ③具
擬南芥轉化
實驗概要本實驗以擬南芥為試材介紹了轉化及篩選的過程。主要試劑1. 滲透培養基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH調至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%瓊脂PNS或水溶液2. 篩選培
北京基因組所單細胞中識別染色質類染色質拓撲的算法
基因組DNA和組蛋白以特定的形式高度折疊在細胞核中，這一高級結構即三維基因組學，對細胞核內的諸多生命活動至關重要。基于染色質構象捕獲（3C），尤其是高通量技術（Hi-C，ChIA-PET）的發展推動了三維基因組的研究，發現了包括染色質拓撲相關結構域（TAD），染色質環等一系列層次化的結構特征。近
研究揭示染色質修飾調控植物基因表達新機制
8月6日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心植物分子遺傳國家重點實驗室何躍輝研究組（與劉仁義研究組合作）和杜嘉木研究組（與美國威斯康辛大學鐘雪花研究組合作）在《自然-遺傳學》背靠背分別發表題為Polycomb-mediated gene silencin
擬南芥葉綠體基因組DNA雙鏈斷裂修復的全新分子機制
2021年6月16日，清華大學生命學院/清華-北大生命科學聯合中心孫前文實驗室在Nucleic Acids Research雜志在線發表題為“RNase H1C與單鏈DNA結合蛋白WHY1/3和重組酶RecA1在擬南芥葉綠體中協作完成DNA損傷修復 (RNaseH1C collaborates
[科學]：研究人員破譯植物開花時間秘密
植物為什么會在不同季節開花?研究人員在新一期《科學》雜志上報告說，其秘密在于一種核糖核酸(RNA)起到了調控作用。 英國約翰·英尼斯中心的研究人員發現的這種核糖核酸名為COOLAIR，是一種反義長鏈非編碼核糖核酸。長鏈非編碼核糖核酸曾被認為沒有功用，現在研究人員發現它能發揮很多重要的功能，
關于染色質的結構單位的介紹
20世紀70年代以前,人們關于染色質結構的傳統看法認為,染色質是組蛋白包裹在DNA外面形成的纖維狀結構。直到1974年Kornberg等人根據染色質的酶切和電鏡觀察,發現核小體是染色質組裝的基本結構單位,提出染色質結構的“串珠”模型,從而更新了人們關于染色質結構的傳統觀念。
染色質結構對轉錄調控的影響
真核細胞中染色質分為兩部分，一部分為固縮狀態，如間期細胞著絲粒區、端粒、次溢痕，染色體臂的某些節段部分的重復序列和巴氏小體均不能表達，通常把該部分稱為異染色質。與異染色質相反的是活化的常染色質。真核基因的活躍轉錄是在常染色質進行的。轉錄發生之前，常染色質往往在特定區域被解旋或松弛，形成自由DNA，這
什么是結構性異染色質？
又稱結構性異染色質，是異染色質的主要類型。是各類細胞的整個發育過程中都處于凝集狀態的染色質。 此類染色質多位于染色體的著絲粒區，端粒區，次縊痕，以及Y染色體長臂遠端2/3區段，含有高度重復的DNA序列，沒有轉錄活性。